研究人员区分促进癌症生长的突变和不促进癌症生长的突变
到目前为止,研究人员认为癌症肿瘤中的复发突变(热点突变)是促进癌症进展的重要突变(驱动突变)。加利福尼亚大学欧文分校领导的一项新研究表明,这并非总是如此。
鉴定对癌症进展重要的驱动基因的方法依赖于患者的复发金标准。看到完全相同的DNA碱基对在许多患者中反复突变已被认为是无可辩驳的证据,证明突变必须有助于肿瘤的发展。然而,今天发表在“ 科学 ”杂志上的这项研究“由APOBEC3A和中尺度基因组特征驱动的癌症中的乘客热点突变” 揭示了许多复发的癌症突变可能是乘客热点突变,对癌症发展并不重要。
“在我们的研究中,我们发现在DNA茎环中发现的某些复发突变,一种常见的DNA结构,实际上是乘客热点,而不是我们原先认为它们的驱动因素。” RémiBuisson博士说,他是UCI医学院生物化学系的助理教授,也是该研究的首席研究员。更重要的是,我们发现在茎环外的DNA位置发现的其他复发突变可能是尚未表征的新驱动因子。我们发现的重要性在于它使我们能够区分突变,这对于开发新的癌症疗法至关重要。“
来自UCI医学院和麻省总医院的研究小组检查了超过9,000例患者肿瘤的癌症基因组中的突变情况和突变分布。他们发现某些热点突变来自称为APOBEC的蛋白质家族(载脂蛋白B mRNA编辑催化多肽样)的活性。
“我们的分析显示APOBEC3A特别强烈偏爱称为茎环或DNA发夹的DNA结构。这种偏好会导致患者肿瘤中出现热点突变,”Buisson说。
每天在人体细胞中发生数万次DNA损伤事件。APOBEC蛋白家族是癌细胞中最常见的内源性DNA损伤事件来源之一。APOBEC3A直接攻击基因组DNA,诱导DNA双链断裂和突变。到目前为止,人们对APOBEC3A如何靶向基因组DNA知之甚少,以及基因组的某些结构是否比其他基因组更容易发生APOBEC3A攻击。DNA茎环结构可以在DNA复制,转录过程中或通过不同的DNA修复过程瞬时产生。这些多种途径为APOBEC3A促进结构特异性胞嘧啶脱氨作用提供了许多机会,有利于患者肿瘤中的乘客热点突变的出现。
这项研究得到了美国国立卫生研究院,国立卫生研究院独立奖学金和马萨诸塞州综合医院癌症研究中心的资助。
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