新的计算框架揭示了关节炎药物对基因表达的影响
一个新的计算框架揭示了四种类风湿性关节炎药物之间的关键差异及其对小鼠生物途径的影响。希腊Biomedcode Hellas SA的Niki Karagianni及其同事在PLOS计算生物学中介绍了他们的新方法和研究结果。
患有类风湿性关节炎的人经常接受靶向和抑制肿瘤坏死因子(TNF)的药物,肿瘤坏死因子是一种参与该疾病的疼痛和破坏性炎症特征的蛋白质。虽然几种抗TNF药物被广泛使用并具有相当的临床成功,但其对生物过程的不同分子效应的细节尚不清楚。
为了填补这一空白,Karagianni及其同事采用了一种慢性炎症性多关节炎小鼠模型,该小鼠表达人类TNF,并发展出与人类疾病形成密切相关的症状和特征。患病小鼠接受四种抗TNF药物之一(Remicade,Cimzia,Humira或Enbrel)治疗,或者为了比较,没有药物。然后研究人员将它们与健康小鼠进行比较
治疗后,研究人员收集了所有小鼠的关节组织并分析了它们的转录组 - 组织中完整的信使RNA分子集,表明哪些基因被打开或关闭。然后,他们对转录组数据应用了一系列计算步骤,以比较四种不同药物的效果。
该分析揭示了四种药物影响患病小鼠基因表达的方式之前未知的差异。对于直接参与关节炎的基因,发现了一些这些差异,但是在非关节炎相关基因中发现了许多差异,例如涉及心血管疾病的基因和可能与关节炎一起发生的其他病症。
也许从我们的研究中得出的最重要的结果是患病动物中大量的下调基因,这些基因与最近被忽视的功能和途径有关。这些可以为关节炎病理机制提供额外的见解。“
为本研究开发的新计算框架可以重新用于其他疾病中其他药物的详细比较。为了帮助实现这一目标,研究人员正在努力将系统组织成一个自动化的独立软件包。
推荐内容
-
闪电链接金属标记试剂盒在多个基于免疫的应用中使用
Expedeon AG今天宣布,它已经推出了闪电链接®金属标记试剂盒在多个基于免疫的应用中使用,支持单细胞分析。新试剂盒将使用户能够显着
-
科普最招癌的7个饮食习惯及多吃玉米有哪些好处
看似简单的一日三餐,不仅为生命提供能量,还潜藏着生命玄机,决定着人体的健康走向。长期不科学、不合理的饮食,最终成为人类健康杀手...
-
吃蛋黄会增肥?听听专家怎么说 一个蛋黄热量真不高
生活中我们经常会听见各种各样的流言,但是只要我们用心去思考和辨认其实 不难发现这些谣言有很多破绽。所以今天,小编照常给大家辟谣一则
-
封控在家太久,焦虑暴躁怎么办?专家给出6点建议
封控在家太久,焦虑暴躁怎么办?专家给出6点建议 今天上午10:00上海市举行第178场新冠肺炎疫情防控新闻发布会▽上海封控时间比较长,
-
新的基于指标的模型用于评估溪流中粪便细菌的传播
粪便细菌 - 存在于人类和动物消化系统中的细菌 - 已知会污染水域。它们有时会对健康造成危害。对河流中粪便细菌的传播和分布进行的研究
-
绿茶可能是降低抗生素耐药性的关键
萨里大学的科学家发现,绿茶中常见的一种天然抗氧化剂可以帮助消除抗药性细菌。这项发表在《医学微生物学杂志》上的研究发现,表没食子...
-
深1℃|集采落地民营医院 郑州非公立医疗机构率先纳入药品医用耗
深1℃|集采落地民营医院 郑州非公立医疗机构率先纳入药品医用耗材集采 大象新闻·映象网记者 米方杰 文 夏雨 视频剪辑日前,人工
-
江苏新增本土无症状感染者47例,在这两地
江苏新增本土无症状感染者47例,在这两地 5月11日024时,江苏无新增确诊病例,新增本土无症状感染者47例(无锡市43例,苏州市4例,均