确定不同微生物群体年龄的突破
包括布里斯托大学在内的国际科学家团队通过创造研究微生物群落时间和共同进化的新技术,在我们了解地球上前四分之三的生命方面取得了重大突破。
为了了解过去,古生物学家转向化石记录。化石的出现,丰度和多样性为动物和植物群的进化历史提供了一个窗口,将它们锚定在绝对的地质时期。
但化石记录对微生物,单细胞生命几乎没有任何好处。微生物很少化石,除了一些明显的例外,可用的化石太模糊,无法揭示哪些群体在特定时间已经存在。
对于进化史的学生来说,这是一个主要问题,因为几乎所有生命的遗传,生物化学和代谢多样性都是微生物 - 无论是现在还是遥远的过去。
虽然大多数微生物肉眼看不见,但它们在回收养分,产生我们需要呼吸的氧气以及维持全球生态系统稳定性方面的集体行动是不可忽视的。
过去,微生物优势甚至更高。目前存在的最常见的大型多细胞生命形式群体,动物,植物和真菌,在进化方面是相对较新的,在过去的五十亿年左右发展。
今天发表在“自然生态学与进化”杂志上的这项研究是国际合作的成果,包括法国里昂的CNRS,匈牙利布达佩斯的EötvösLoránd大学和布里斯托尔的生物科学学院的研究人员。
在其中,研究人员开发了一种新的方法来计算微生物群的相对年龄 - 哪个谱系首先进化,后来出现?
该方法不是使用化石枣,而是通过观察古代微生物之间水平基因转移的事件,通过研究其现代后代的基因组来检测。
水平基因转移是许多微生物用来从生活在同一栖息地的其他细胞中获取新基因的过程,它是抗生素抗性快速传播的基础,但也是微生物适应新生态位的更普遍的方式。
来自布里斯托尔的该研究的共同作者之一汤姆威廉姆斯博士说:“该方法的关键是从一个谱系到另一个谱系的基因转移意味着树的这两个分支必须在大致相同的时间存在:特别是,水平转移基因的接受者必须与供体谱系的年龄相同或更年轻。
“通过系统地扫描现代基因组中的古代基因转移,我们获得了一组相对年龄限制,这些限制结合起来提供了关于不同微生物群体相对年龄的丰富信息。”
这些结果为几个没有可靠化石证据的微生物群提供了首次排序,其中包括古细菌 - 细胞生命的两个主要谱系之一。
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