分析人体中的水平基因转移

人体中的细菌以比通常在自然界中看到的更高的速率彼此共享基因。今天发表在“科学报告”上的研究结果源于一种分子数据挖掘方法，该方法允许科学家识别水平基因转移的实例 - 基因在有性或无性繁殖之外的生物之间的直接转移。

“水平基因转移是地球上遗传信息交换的主要力量，”伊利诺伊大学的共同作者Gustavo Caetano-Anollés说。“这些交换使微生物适应和繁殖，但它们可能对人类健康也很重要。有些细菌不能生活在我们体外，还有一些细菌无法生存。“

为了进行分析，科学家利用基因组信息构建了数以万计的殖民人体“家谱”。通过与微生物基因树木调和，使团队能够弄清楚哪些基因是遗传的，哪些是由水平基因转移引起的。

研究人类相关微生物，研究人员计算了基因转移率，发现只有约40%的基因交换发生在同一身体部位的细菌中。另外60%涉及不同组织中细菌之间的基因共享，例如，肠道和血液中的生物之间。在所有情况下，基因转移在密切相关的生物体中最常见，无论它们是否占据相同或不同的身体组织。“目前用于确定水平基因转移的大多数方法比较DNA特征或基因组之间的统计相似性以鉴定外源基因。这对于相对较新的基因转移非常有效，但往往无法确定数百万或数十亿年前发生的转移事件，“COMSATS大学伊斯兰堡的高级作者Arshan Nasir说。

纳西尔说：“其中一些可能是在微生物定植于人体之前发生的非常古老的基因转移事件。”“也可能是某些细菌在个体生命周期的不同时间点定居在不同的人体部位。其他可能是细菌DNA从一个位点转移到另一个位置的结果，可能是通过血液。我们需要进一步的实验证据来测试这种诱人的可能性。“

其他科学家可以使用研究人员开发的工具-HGTree-为了更准确地预测哪些基因是垂直遗传而不是水平遗传。

郑重声明：本文版权归原作者所有，转载文章仅为传播更多信息之目的，如有侵权行为，请第一时间联系我们修改或删除，多谢。