在小RNA上释放TIGER
2019-03-24 14:16:02
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努力探索小RNA(sRNA)的景观 - 短时间难以理解的RNA分子 - 通常使用高通量测序(sRNA-seq)。由于缺乏识别,量化和分析sRNA-seq数据集中所有不同sRNA的工具,这些努力受到阻碍。
Kasey Vickers博士及其同事现在开发了一种名为TIGER(细胞外sRNA的整合基因组分析工具)的新分析方法。为了证明这种工具的强大功能,他们对小鼠脂蛋白,胆汁,尿液和肝脏进行了sRNA-seq。在最终的数据集中,TIGER能够识别大约60%的脂蛋白上的sRNA和超过85%的胆汁,尿液和肝脏中的sRNA。
研究人员发现脂蛋白上的大多数sRNA是来自微生物组和环境中细菌来源的非宿主sRNA。
这项研究在细胞外囊泡杂志上发表,揭示了新的脂蛋白和生物流体sRNA,并表明TIGER非常适合sRNAs的研究。
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