加拿大lynx基因组的首次测序
马萨诸塞州阿默斯特大学的科学家本周与纽约脊椎动物基因组实验室(VGL)合作,发布了加拿大ly((Lynx canadensis)的首个全基因组。据麻省大学阿默斯特分校环境保护博士候选人坦尼亚喇嘛协调员Tanya Lama说,它是14个被发布到公共数据库供研究进化,疾病,遗传和保护的研究人员之一。
研究人员将于9月12日星期三在纽约洛克菲勒大学的VGL召开新闻发布会,宣布基因组发布。
同样隶属于美国地质调查局马萨诸塞州合作鱼类和野生动物研究部门的喇嘛说,作为一种保护遗传工具,该基因组提供了有关该物种的遗传健康,人口统计学和进化史的信息。它还有助于使用对真实世界景观的种群大小,基因流和适应性遗传变异的精确估计来描述常驻动物的生存能力。她补充说,这些信息对野生动物管理和政策决定至关重要。
特别是,她和同事们希望更多地了解缅因州lyin与新不伦瑞克省和魁北克省的邻近人口之间的关系,以及他们与加拿大东部核心ly people种群之间的关系,这是“强大的障碍”,即圣劳伦斯河。
喇嘛指出,“遗传学可以帮助我们更好地了解缅因州lynx种群的动态以及它是否能够在未来保持活力。如果种群变得小而孤立,它们更容易受到人口和环境变化的影响而且更高成为当地绝种的风险。“
加拿大ly is于2000年被美国鱼类和野生动物管理局列为威胁,是一种北美猫科动物,原产于加拿大北部的北方森林和美国北部的类似栖息地,尤其是缅因州。美国鱼类和野生动物管理局最近的一项建议是,建议将濒临灭绝的物种法案保护从lynx中除名。
如果退市,将制定一项监测计划,有关缅因州人口状况及其与邻近人口的连通性的信息对制定保护战略极为重要。即使在恢复过程中,喇嘛也表示lynx将需要监测和保护行动来追踪气候变化和栖息地丧失。
她的联合顾问,马萨诸塞州合作鱼类和野生动物研究部门负责人Stephen DeStefano和USGS合作鱼类和野生动物研究部门项目负责人John Organ表示,缅因州,新不伦瑞克省和魁北克省的人口之间存在连通性。劳伦斯是生存能力的关键,基因组工具可以帮助确保制定适当的保护措施。
器官指出,“河流南部的这些人群之间的连通性可能对其持久性至关重要,如果有必要,土地保护策略将被设计用于促进整个景观的移动和基因流动。”
为此,喇嘛协调一个包括DeStefano和Organ的团队,以及华盛顿特区史密森学会的保护遗传学家Warren Johnson,缅因州内陆渔业和野生动物部的Jennifer Vashon及其同事,以及洛克菲勒大学VGL的生物信息学专家。
喇嘛对她说,本周的公共基因组揭晓不是结束,而是多年分析的开始。作为保护遗传学家,史密森学会的她和约翰逊将分析数据,制作报告并解释对于保护团队在明尼苏达州,蒙大拿州/东北爱达荷州,华盛顿州,大黄石地区和科罗拉多州。
约翰逊说,像lynx这样的可见和标志性物种“为探索物种和自然环境之间复杂的生物,生态相互作用提供了一个很好的机会,并且是使用基因组方法为我们的决策提供信息的一个很好的模型。”
DeStefano补充说:“任何时候我们都可以获得更多有关其人口健康状况的信息,我们会接受它。许多自然保护主义者对这只美丽的猫的未来非常感兴趣,”他指出。
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