新研究能够降低基因编辑的出错几率
最近,韩国IBS基因组工程中心的研究人员已经确定了基于CRISPR靶向腺嘌呤的基因编辑工具(ABE)的错误率。对这一工具的错误率的评估对于其在临床和生物技术中的应用至关重要。他们的研究结果发表在Nature Biotechnology上。
DNA的四个碱基:腺嘌呤(A)与胸腺嘧啶(T),胞嘧啶(C)与鸟嘌呤(G)结合,形成32亿字母的独特组合,这构成了我们的遗传物质。一些遗传性疾病是由一个字母的突变引起的,对此,CRISPR能够通过处理这种单碱基突变起到修复遗传疾病的效果。一直以来,IBS团队对研究这一工具的特异性感兴趣。
由Jin-Soo Kim领导的研究小组研究了人类细胞中最近开发的ABE蛋白ABE7.10的错误率。他们确定了受ABE7.10影响的人类基因组位置,并扫描了超出目标的错误。为此,他们使用了改编版的Digenome-seq技术。修改后的Digenome-seq可以检测整个人类基因组中平均60个脱靶错误。有趣的是,尽管这三种蛋白质被设计成针对同一个位点,但它们识别出不同的脱靶点。
IBS生物学家还展示了一些策略来抑制脱靶修改的数量。在guide RNA末尾添加几个G减少了脱靶错误,以及使用不同类型的Cas9。通过预装配的核糖核蛋白,而不是通过质粒,等等。
该团队旨在为ABE的发展做出贡献,以更精确和有效的方式引入所需的单字母变更。 “随着基础编辑器的准确性得到证实,我们预计它将在未来的医疗和农业领域得到广泛应用,”Jin-Soo Kim说。
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