Crispr发明抗菌肽whodunit
按照神秘作家阿加莎·克里斯蒂(Agatha Christie)所理解的策略,科学家们开发出一种方法来研究抗菌肽(AMPs)在体内环境中的表现,而不是通常的体外环境。为了实现这一壮举,科学家们使用CRISPR-Cas9基因编辑系统地敲除AMP基因,最终敲除了动物模型中果蝇的所有已知AMP基因。这项工作旨在产生一种澄清效果 - 而且它的确以科视Christie的风格和然后没有。
尽管它们在先天免疫中具有重要性,但AMP仍然是神秘的。根据一些体外研究,AMPs可以杀死细菌和真菌,但AMPs在生物体中的行为不太容易评估。其中一个原因是先天免疫中涉及太多因素,因此在生物体中分离单个AMP的作用是一个非常复杂的命题。
为了揭示AMP在体内的作用,位于洛桑联邦理工学院(EPFL)的科学家利用了名为CRISPR-Cas9的研究工具。在EPFL教授Bruno Lemaitre的带领下,他们使用基因编辑系统从果蝇Drosophila中删除了不少于14个AMP 。通过删除单个AMP基因,各种基因组合,甚至所有14个基因,科学家们能够移除相应的AMP并观察它们的缺失如何影响苍蝇对不同细菌和真菌病原体的抗性。
2月26日,eLife杂志发表了一篇题为“ 使用系统敲除方法在体内抗菌肽的协同作用和显着特异性 ”的文章。
“我们发现果蝇 AMP主要作用于革兰氏阴性细菌和真菌,可以相加或协同作用,”该文章的作者写道。“我们还描述了显着的特异性,其中某些AMP对特定病原体有很大的杀微生物活性,在体内环境中提供高度特异性AMP-病原体相互作用的功能性证据。”
从本质上讲,科学家发现AMP可以一起工作,也可以通过累加各自的效果。令人惊讶的是,他们发现某些AMP在防御某些感染方面具有非常特异性(例如,针对病原体P. rettgeri的AMP 双萜)。这种意外的结果突出了先前未知的先天免疫反应特异性水平。
“真正令人兴奋的是,这些结果将帮助我们了解我们自己的AMP如何帮助对抗感染,”该研究的第一作者Mark Austin Hanson说。“可能有些人有一个特定AMP的缺陷副本,需要预防常见的感染 - 例如,尿路感染的大肠杆菌 - 因此他们的风险更高。对抗感染是很好的,但首先学习如何预防它是医学的理想。这就是这些AMP的作用:它们可以在感染进入之前预防感染。“
但Hanson补充说,研究AMP的应用更进一步。“研究苍蝇的AMP如何发挥作用也可以帮助我们管理经济上重要的昆虫,无论是保护大黄蜂还是防止蚊子传播疾病。”
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