辐照炭疽可以快速排序
这些天,发往指定政府办公室的邮件被照射,以杀死任何生物制剂,特别是炭疽孢子。其缺点是需要可行的孢子来鉴定炭疽菌株,这对于治疗感染者至关重要。但是现在,Henry S. Gibbons博士已经表明,可以从辐射的孢子中快速确定完整的序列。该研究于11月13日在美国微生物学会期刊“ 应用与环境微生物学 ”上发表。
在这项研究中,研究人员对萎缩芽孢杆菌(Bacillus atrophaeus)的孢子进行了辐照,这是一种非致病菌株,与炭疽病一样,可以制造孢子。与参考菌株相比,作者使用的菌株具有许多基因突变,他们希望它们可以检测到。他们还使用了鼠疫耶尔森氏菌疫苗株,这种细菌会引起鼠疫,但不会形成孢子。辐照将DNA序列分解成片段。研究人员对片段进行了测序,然后记录了序列。他们将片段序列输入计算机,计算机将其编程以确定菌株的完整序列。
“完整的序列几乎与对照材料难以区分,”吉本斯说。“在辐照材料中发现了所有已知的突变。”Gibbons是马里兰州阿伯丁试验场美国陆军埃奇伍德化学生物中心的研究微生物学家,他说,这项研究的动机是需要在2001年炭疽袭击等故意释放后迅速恢复微生物特征。
这些袭击事件发生在9-11之后一周,部分针对国会办公室,造成一名照片编辑,两名邮政工作人员和另外两名工作人员死亡,这是25年来美国第一次炭疽病死亡。“从生物芯片中快速测序辐射材料可以快速鉴定材料,”吉本斯说。这可以回答重要问题。例如,基因组可能包含耐药盒,这是了解如何治疗任何感染的重要信息。
Gibbons表示,更一般地说,快速测序还可以揭示菌株是否经过基因工程改造。“这是炭疽病调查中提出的第一个问题之一。这是因为苏联计划已经开发了一些工程病原体。” 他说,这也有助于确定肇事者的复杂程度,这对追踪肇事者很重要。
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