定量完整的人类蛋白质组
在期刊Cell中报道系统生物学研究所(ISB)的高级研究科学家Ulrike Kusebauch博士介绍了ISB,苏黎世联邦理工学院和其他一些研究机构合作开发人类SRMAtlas的结果,这是一个蛋白质组学分析的概要。任何人类蛋白质。人类SRMAtlas是高度特异性质谱分析的概要,用于预测人类蛋白质组中任何蛋白质的靶向鉴定和可重复定量,包括许多剪接变体,非同义突变和翻译后修饰的分析。使用称为选择反应监测的技术,使用166,174个充分表征的化学合成的蛋白质型肽开发了测定法。
SRMAtlas资源可在http://www.srmatlas.org免费公开获取,同样有益于集中,假设驱动和大型蛋白质组规模研究。我们期望这种资源将显着推进基于蛋白质的实验生物学,以了解疾病转变和健康轨迹,因为任何人类蛋白质现在原则上都可以在任何样本中被识别和量化。
在任何组织或细胞类型中可靠且可重复地测量人类蛋白质组的任何蛋白质的能力是变革性的,用于理解系统水平特性以及生理学和疾病中的特定途径。在ISB的罗伯特莫里茨教授的实验室中,通过称为选择反应监测(简称SRM)的方法,协作努力生成并验证了高度特异性靶向蛋白质组学分析的纲要,现在提供了20,277个注释的99.7%的量化。人体蛋白质由广泛可及,灵敏且稳健的靶向质谱法选择反应监测,SRM。该人SRMAtlas提供确定的测定坐标,其最终鉴定生物样品中的相应肽。
尽管2003年人类基因组计划在创建所有人类基因库存方面取得了成就,但大多数蛋白质研究仍然集中在人类基因组绘制之前研究的相同的相对较小的蛋白质子集上。为了超越这种停滞不前的蛋白质组学研究方法,需要开发基本上每种人类蛋白质的高度特异性检测方法。有了人类SRMAtlas这样的资源,测量任何蛋白质的前景现在都成了现实。人类SRMAtlas现在提供基于SRM技术的经过验证的MS测定,所述SRM技术基于人蛋白质组的基本上每种蛋白质以统一且一致的方法开发。这些分析可以快速部署在系统生物学和生物医学研究中,以高灵敏度和高选择性鉴定和定量任何人类蛋白质,
个性化医疗将依赖于分子特征来监测健康状况并提供信号以识别健康轨迹的变化并提供信息以使正确的患者与正确的药物匹配,首先在临床试验中,然后在临床实践中。人类SRMAtlas计划将蛋白质组学牢牢地推向了最前沿,并为蛋白质组学提供了进一步的弹药,以在癌症Moonshot日益全球化的努力中发挥重要作用。
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