团队映射黑色飞行的基因组可能有益于人类健康促进害虫管理

印第安纳大学普渡大学印第安纳波利斯分校科学学院的研究人员对黑蝇的基因组进行了测序，这种蝇是一种常见于美国，加拿大南部和北欧部分地区的昆虫。黑蝇有环境，医疗和法医用途，作为自然界的回收者，伤口清洁剂和法医计时员。它们具有蓝色或绿色光泽，并且与普通家蝇相似。

发现雌性基因组含有8,312个基因; 雄性基因组有9,490个基因。“没有什么特别的关于黑蝇(科学名称Phormia regina)，但缺乏独特性是科学家们对研究它们感兴趣的原因，”生物学和法医科学助理教授克里斯蒂娜皮卡德说，他带领团队排序基因组。

皮卡德提供了以下类比来解释她对黑蝇的研究兴趣：“例如，如果你对研究特定的人类疾病感兴趣，那么你不要从研究患有这种疾病的人开始。你首先要研究健康的个体，并且然后你寻找健康和病人之间的差异，以确保你观察到的任何差异实际上是由于疾病而不是由于其他因素。

“第一步是弄清楚正常是什么。这就是为什么我已经研究了这种苍蝇十年了，我们过去五年一直在研究它的基因组测序：因为这是一种基本上不起眼的昆虫。它不是'做任何异常的事情。对黑蝇基因组进行测序后，我们正在为正在研究具有异常或危险特征的其他昆虫的所有研究人员提供主要资源，例如一种致命袭击牲畜的苍蝇。“

黑蝇是活跃的昆虫，执行三项有益于人类的任务：回收腐肉，清除人类伤口和在新鲜尸体上产卵。它们没有有害或寄生行为。

黑蝇以腐烂的肉为食，有助于消耗整个环境中死亡的脊椎动物。黑斑蝇幼虫或蛆在医学上用于清除人类伤口，因为昆虫物理地去除死组织，同时将抗微生物化合物排泄到伤口中。黑蝇苍蝇具有极好的嗅闻最近死亡的组织的感觉，通常是第一批在人体内定殖的昆虫，通常在死后几分钟内。女性在最近死亡的尸体上产卵，设置了一个“时钟”，使法医调查人员能够估计死后时间间隔或死亡后的最短时间。

其他基因绘图项目由大型国际财团组织开展，其中一个小组在一个方面开展工作，另一个小组在不同方面开展工作，作为一个合作项目。IUPUI的黑色吹蝇基因组测序主要由生物学博士候选人Anne Andere在皮卡德的指导下进行了四年，并得到德克萨斯理工大学生物学家RN Platt II和David A. Ray的投入。

“ Phormia regina Meigen的基因组序列(双翅目：Calliphoridae)：对医学，兽医和法医学研究的影响”在BMC Genomics在线发表。研究生安德瑞是第一作者。相应作者皮卡德是生物学系和法医与调查科学计划的助理教授。她在法医昆虫学和分子生物学的界面工作。

昆虫占地球上所有生物物种的一半以上。2011年，i5K启动了一项计划，即在五年内对5,000种昆虫和其他节肢动物的基因组进行测序。然而，到目前为止，只有239种节肢动物基因组已被测序，现在可以获得黑色飞行基因组。

“现在我们已经描述了基因组，”皮卡德说，“我计划继续努力更好地了解从一个地方到另一个地点的黑飞行种群变异，并展示这些变化如何影响死后时间间隔估计，目的是制作这些重要的决定更准确。“

皮卡德说，黑色吹蝇基因组的绘图也将有助于研究人员更好地了解杀虫剂的敏感性和抗药性。对基因组的了解也将促进对这些特定昆虫分泌的抗微生物化合物的理解。

在IUPUI完成的黑色吹蝇基因定位结果已经存放在国家生物技术信息中心的序列阅读档案数据库中，并且可供世界各地的研究人员使用。

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