便携式DNA测序仪帮助非洲农民对抗作物病害

西澳大利亚大学的科学家们正在东非首次使用新的便携式DNA测序技术，以帮助农民对抗作物病害的破坏性影响。使用便携式实时DNA分析设备，与病害木薯作物作斗争的农民可以根据有关植物健康的信息立即采取措施挽救他们的生计。DNA手持式测序仪，名为MinION，由英国公司Oxford Nanopore开发。它被用来确定哪种病毒株正在摧毁坦桑尼亚和乌干达农民的木薯作物，这是科学家和农民合作的一部分，称为木薯病毒行动计划(CVAP)。

西澳大学高级研究员Laura Boykin博士是该项目的主要研究人员之一，坦桑尼亚Mikocheni农业研究所所长Joseph Ndunguru和乌干达国家农业研究组织研究项目负责人Titus Alicai。Boykin博士说，因为MinION能够实时提供信息，与通常的三个月相比，农民能够更快地采取行动。

全球有8亿人依赖受威胁的木薯作物，该团队现在计划扩大该项目，旨在降低社区作物歉收的风险并帮助维持生计。

木薯是木薯来源的碳水化合物作物，在发展中国家的农业中发挥着关键作用。它目前被几种导致两种疾病的病毒所摧毁; “木薯花叶病”(CMD)导致了20世纪20年代和90年代的大饥荒，以及“木薯褐条病”(CBSD)，其流行病在东非迅速扩散。

由粉虱携带的这两种疾病都阻止了木薯植物的正常生长。这导致农民的收成显着减少甚至完全损失。病毒使植物不能食用和不可销售，必须销毁作物以阻止其蔓延。

Ndunguru先生说：“我们已经证明口袋DNA测序仪可以使那些通常无法获得这些技术的农村社区受益，因为它们通常更昂贵，更慢。”“即使在这个试点项目中，通过快速准确地识别病毒，农民现在可以了解哪些作物可以种植，这些作物对特定病毒种类/菌株具有抗性。这是获得持久抗病性和提高作物生产力的关键。它也易于使用，无需大型基础设施和人员配备。

Boykin博士说，该团队计划在坦桑尼亚和乌干达扩大该项目，并与尚未受到木薯粉虱病毒影响的其他国家合作，如泰国和巴西。“如果没有找到更好的策略来应对这种作物病害，那么数百万人可能会受到影响 - 我们需要考虑经济以及个别家庭，”她说。

MinION重量仅为100克，可用于任何可以插入笔记本电脑或PC的地方，用于对木薯植物和粉虱进行测序，从而确定存在的病毒的精确菌株以及品种农民种植的木薯

木薯疾病诊断项目由比尔和梅林达盖茨基金会和英国国际发展部共同资助

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