跳跃基因的党纪
跳跃基因,转座子,是大多数生物的基因组的一部分,聚集到家族中并且可以通过跳跃来破坏基因组。主机如何抑制跳跃是很好的调查。到目前为止,为什么他们仍然可以跳跃。Vetmeduni Vienna的研究人员首次在宿主生物的所有转座子中进行了研究,这些属性和寄主环境促进了跳跃。他们表明家庭关系比职位更重要。
典型生物的基因组由许多像珠子一样被串起的基因组成。即使在很长的进化期内,这种对齐也令人惊讶地稳定。除了这些基因之外,还有许多移动元素,称为寄生虫,它们遍布整个基因组并根据它们的相关性聚集到不同的家族中。这些跳跃基因,即转座子,可以很容易地改变它们的位置。因此,他们的地位尚未得到进化保守。例如,当他们改变自己的位置时,他们可以直接跳入功能基因,从而改变这些基因的功能甚至完全灭活它们。因此,宿主生物已经学会控制和减少跳跃。
然而,尽管采取了所有保护措施,但在压力情况下,转座子家庭可能会发生大规模的动员。他们必须为这些情况提供特定工具(RNA)。但是,生产这些工具的决定性信息是什么?来自维也纳兽医大学人口遗传学研究所的研究人员现在首次证明,每个转座子家族以不同的方式解释细胞中的信号,并使用不同的策略来决定何时激活跳跃工具在基因组中。
跳跃基因是寄生虫
虽然生物体基因组中转座子序列的比例可能很高 - 人类约占45% - 但它们是不可信的。它们的跳跃行为主要损害基因组的结构。不受控制的传播会导致细胞死亡。因此,转座子研究的重点是有机体用来抑制跳跃的策略。尽管有这些保护措施,转座子在特定的环境条件或压力下跳跃。该观察结果表明,转座子必须具有避免这种控制的机制。转座子需要合适的跳跃工具。但尚未对其进行了解,也未对所有转座子家族进行调查,了解这些工具的生产是如何受到规范的。
因此,AnaMarijaJakšic的研究在全基因组分析中研究了转座子如何为跳跃做好准备。为此,研究人员将两种不同的果蝇种群暴露在不同的温度下。然后他们使用“下一代测序”方法绘制出跳跃基因的序列。他们可以证明几乎所有家庭都生产能够跳跃的工具,但程度取决于两个不同的因素。
“我们的研究表明,转座子的活性不仅取决于它们自身,还取决于宿主细胞产生的因子,”Jakšic解释说。在转座子的基因序列中,存在宿主特异性因子的结合位点,其正向调节细胞中基因的转录。因此,两个因素合作 - 家族特异性结合位点和通过环境和遗传背景调节的宿主因子。“由于一个家庭的所有成员具有相同的结合序列,所有家族成员的副本,在整个基因组中传播,对环境影响的反应方式相同,”主要作者说。
相关转座因素的党纪
“对我们来说,重要的是要看到基因组中的位置对转座子的活性没有很大的影响,”最后一位作者ChristianSchlötterer说。“由于转座子家族的成员彼此非常相似,他们也分享了大部分的结合位点。这意味着:当给出跳跃信号时,这会影响整个家庭 - 在某种意义上的党纪。”
跳跃的准备可以提供有价值的信息,不仅关于转座子本身,还关于位置变化的影响。跳跃基因的插入对于基因组的结构不一定是坏的。“尽管转座子由于其主要的有害诱变作用而声名狼借,但它们的新位置会对邻近基因产生积极影响。这很快就会导致功能性创新。一个很好的例子是果蝇对杀虫剂的抗性:它们对滴滴涕具有抗药性因为跳跃的转座子,“雅克西奇说。
进一步探索: 追踪玉米的跳跃基因
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