用新的DNA测序方法暴露丛枝菌根真菌群落
大多数陆生植物的根源是丛枝菌根真菌，它们可以帮助植物生长，同时也影响更广阔的环境。它们隐藏的性质意味着对这些真菌知之甚少，但芝加哥植物园和西北大学的研究人员已经开发出一种新方法来检测和鉴定这些生态重要群落中涉及的许多物种。
丛枝菌根真菌与约65-75%的陆生植物配合，为它们提供土壤中的养分，以换取光合作用过程中产生的糖分。这些真菌群落对可以在特定位置生长的植物类型产生巨大影响，科学家们渴望更多地了解它们的多样性和生态效应。然而，丛枝菌根的性质意味着真菌在植物组织内生长，因此判断特定环境中存在哪些物种可能是棘手的。
虽然DNA测序已被用于鉴定某些地区约350种最丰富的丛枝菌根真菌，但这些方法不太可能全面描述特定环境中的物种。为了更好地描述丛枝菌根真菌的多样性，博士候选人Benjamin Morgan和他的主管Louise Egerton-Warburton博士开发了一种新技术，能够检测社区中罕见的真菌物种，为将来洞察它们如何变化铺平了道路以应对环境变化。他们的研究结果发表在最近一期的“ 植物科学应用”中。
Morgan和Egerton-Warburton建立在丛枝菌根群落特征描述的最新进展基础上，通过采用经过验证的真菌特异性DNA测序工具，使用最先进的技术。他们在引物中添加了“条形码”标签，这些分子与DNA结合，使其能够与极其敏感的高通量DNA测序设备一起使用，以检测稀有物种。
研究人员利用这种新方法分析了墨西哥尤卡坦半岛两个森林的土壤和根系样本，揭示了迄今为止记录的物种丰富度最高的一种。他们确定了2,213个“业务分类单位”(OTU)，它们代表不同物种或来自较小物种的遗传变异个体。丛枝菌根真菌群落以少数非常常见的真菌为主; 只有22个OTU占该研究中鉴定的DNA序列的89%。摩根详细阐述，“大量支持良好的OTU令人惊讶，并且可能反映了这种方法的敏感性增加及其捕获稀有分类群的能力，这些分类群在基于孢子的群落分析和其他测序方法中很容易被忽视。”
研究人员还对两个研究地点的真菌群落之间的差异感到好奇，这两个研究地点的植物群落非常相似，相距仅50英里。土壤中的碱度和土壤中的氮和磷水平导致某些物种在一个地点或另一个地点更为常见，差异在较稀有的OTU中最为明显。摩根解释说，未来的研究可能会揭示更多的环境相互作用：“这实际上只是两个丛枝菌根真菌群落的快照。鉴于湿/干季节性对这些系统的生态学的巨大重要性，更广泛的季节性重采样一直是我们对目前发表的工作的后续行动的主要目标“。
丛枝菌根真菌系统在其环境中起着至关重要的作用，影响在那里生长的植物以及从土壤中储存和释放的养分。这项研究是我们扩展这些系统知识的一个有希望的开端。摩根继续说道，“全球丛枝菌分子真菌多样性很可能远高于目前的估计。鉴于它们在塑造生态系统方面的重要性，我们有兴趣更多地了解这些物种及其可能的功能，特别是在可能由于未来几十年的人为干扰和气候变化而发生重大变化。“
推荐内容
-
用于消除活猪病毒的基因编辑
eGenesis，一家生物技术公司，专注于转化异种移植成救生医疗程序，公布的一项研究在杂志出版科学的eGenesis科学家和他们的合作者表明PERV的
-
新版DNA编辑系统纠正了基于RNA的疾病的潜在缺陷
直到最近，CRISPR-Cas9基因编辑技术才能用于操纵DNA。在2016年的一项研究中，加州大学圣地亚哥分校医学院的研究人员利用一种称为RNA靶向Cas
-
自然界的20个氨基酸遗传密码是利用扩展的遗传密码优化进化蛋白质
近年来，科学家们利用扩增的遗传密码对细菌进行了改造，使之产生由更广泛的分子构建块制成的蛋白质，这为蛋白质工程开辟了一个有前途的...
-
藜麦基因组加速粮食安全解决方案
一个国际科学家团队，包括来自瓦赫宁根大学和研究中心的藜麦育种专家，于2017年2月8日在Nature杂志上发表了藜麦的完整DNA序列 - 征服世界
-
曲塘中学道德标兵投票开始
经各班民主推荐，年级部考评，共有64位优秀同学被确定为曲塘中学道德标兵 助人为乐、敬师孝亲、团结友善、勤奋自强等四个类别网络投票候选
-
使用新的纳米抗体工具重新定位蛋白质
巴塞尔大学Biozentrum的研究人员开发出一种新方法，通过该方法可以将蛋白质转运到细胞中的新位置。这种新颖的工具使科学家能够通过使用纳米
