25个新基因组 以庆祝桑格研究所25年
为了纪念Wellcome Trust Sanger Institute于2018年年满25岁,该研究所及其合作者正在对25个新的基因组进行测序。从黑莓到知更鸟,丛林蟋蟀到褐鳟鱼,这25种都存在于英国,代表着这个国家丰富的物种。已经确定了20种,其余5种将由公众和学童投票选为“我是科学家,让我离开这里”的一部分。结果将公开发布,并将导致未来的研究,以了解英国的生物多样性,并有助于保护和理解这些物种。
桑格研究所由Sir John Sulston教授于1993年创立,作为人类基因组计划的一部分。该研究所对第一个人类基因组的金标准序列做出了最大的单一贡献,该序列于2003年出版。
甲基因组是一个生物体的完整集的写入DNA的遗传指令。每个基因组都包含构建该生物体并使其生长和发育所需的所有信息。
自人类基因组标志性建成以来,桑格研究所已成为全球公认的基因组学领域的领导者。许多更重要的参考基因组已经被测序 - 从小鼠和斑马鱼基因组到猪,大猩猩,蚊子和许多其他基因组。除动物物种外,传染病和细菌在参考基因组列表中也占有突出地位,从沙门氏菌和MRSA到衣原体和疟疾。所有这些都提供了关于这些物种在健康和疾病方面的重要见解。
现在,桑格研究所及其合作伙伴正在全面测序来自英国的25种物种。该项目对一项更大规模的工作做出了很小的贡献,来自世界各地的科学家们聚集在一起制定了一个计划,对地球上的所有生命进行排序。
高质量的基因组将为科学家们利用这些信息打开大门,研究人员可以发现英国物种如何应对环境压力,以及他们在遗传学中保持什么秘密,使他们能够蓬勃发展或挣扎。
Wellcome Trust Sanger研究所所长Mike Stratton教授说:“二十五年前,基因组学领域是一个萌芽的想法,其意义只是梦想的。今天,基因组学和生物数据的现实是它正在改变我们的理解,疾病的诊断和治疗,从癌症和心脏病到疟疾和感染。推动这一发现时代的科学和技术正在加速我们对人体的理解,也加速了我们对周围世界的理解。
这个项目是在世界各地进行了许多深思熟虑的对话之后,关于我们这个星球上有多少物种在未来几十年内可以进行排序 - 原则上,所有这些都是如此。我们正在着手为地球上的所有生命做出贡献。“
Wellcome Trust Sanger研究所副主任Julia Wilson博士说:“通过对这25个基因组进行测序,科学家将更好地了解英国物种,它们是如何到达这里的,它们的进化以及不同物种如何适应不断变化的环境结果可以揭示这些物种中隐藏的真相,并使科学界能够了解我们的世界是如何在我们周围不断变化和发展的。我们希望以特殊的“桑格”方式庆祝桑格研究所成立25周年,我很高兴看到25基因组计划如何展开。“
PacBio长读序列技术使该项目成为可能,该技术可为组装生成高质量的基因组。该研究所正在与PacBio和其他技术领域的领导者10x Genomics和Illumina合作,以创建这些基因组的最全面的视图。
根据它们所具有的品质,这25种物种分为五类:蓬勃发展,英国种类繁多; 濒临灭绝,濒危和衰退的物种; 危险,入侵和有害物种; 我们都认识到的标志性的,典型的英国物种; 隐秘的物种,仅凭外观,看不见或与其他物种无法区分。
自然历史博物馆生命科学负责人蒂姆·利特伍德说:“自然历史博物馆很自豪能与桑格研究所合作庆祝他们的25岁生日,并庆祝基因组测序等分子技术可以带来的进步。研究英国野生动物。我们关注的8000万个标本来自世界各地,拥有丰富的遗传信息,使我们能够开展创新研究,应对全球挑战。特别欢迎以最先进技术关注英国生物多样性。“
到目前为止,已经确定了25个物种中的20个,其余的“五大”将由学童和公众投票选出,作为“我是科学家,让我离开这里”的一部分,从11月6日开始2017年12月8日。来自桑格研究所,更广泛的惠康基因组校园,自然历史博物馆和其他机构的科学家和团队将为一个物种提供支持,并正面对面进行公众投票。最后五个站点将完成发送给序列发生器的物种集。
自然历史博物馆公民科学项目经理Lucy Robinson说:“让学校学生和英国人民负责科学研究的方向是很棒的。通过与科学家聊天和使用在线平台投票,他们可以将这种基因组研究引向他们真正关心的物种和问题。“
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