在人类微生物组中发现了100多种新的肠道细菌
从事肠道微生物组研究的科学家已经从健康人的肠道中发现并分离出100多种全新的细菌。来自澳大利亚哈德森医学研究所Wellcome Sanger研究所和EMBL欧洲生物信息学研究所的研究创造了迄今为止最全面的人体肠道细菌系列。这将有助于全世界的研究人员研究我们的微生物组如何保持我们的健康,以及它在疾病中的作用。
今天(2月4日)在Nature Biotechnology上报道,新资源将使科学家能够比以往更准确,更快地检测人体肠道中存在的细菌。这也将为开发治疗诸如胃肠道疾病,感染和免疫疾病等疾病的新方法奠定基础。
大约2%的人体重是由细菌引起的,肠道微生物组是一个主要的细菌部位,是人类健康的重要贡献者。我们的肠道微生物组不平衡可能导致疾病和复杂的疾病,如炎症性肠病,肠易激综合征过敏和肥胖。然而,由于许多种肠道细菌在实验室中极难生长,因此我们对它们的了解存在巨大差距。
在这项研究中,研究人员研究了来自英国和加拿大的20个人的粪便样本,并成功地从这些样本中生长并对737个单独的细菌菌株进行DNA测序。对这些分离株的分析揭示了273种不同的细菌种类,包括173种以前从未测序过的细菌。其中,有105种甚至从未被分离过。
来自Wellcome Sanger研究所和澳大利亚哈德森医学研究所的论文的第一作者Samuel Forster博士说:“这项研究已经创造了最大,最全面的人类健康相关肠道细菌公共数据库。肠道微生物组在健康和疾病方面起着重要作用。这一重要资源将从根本上改变研究人员研究微生物组的方式。“
了解肠道微生物组如何影响人类健康的标准方法包括对来自肠道细菌混合样本的DNA进行测序,以试图了解每种成分。然而,由于缺乏单独分离的细菌和参考基因组,这些研究受到严重阻碍。
新的培养物收集和参考基因组将使研究人员更加便宜和容易地确定哪些细菌存在于人群中并研究它们在疾病中的作用。
来自EMBL欧洲生物信息学研究所的作者Rob Finn博士说:“对于试图找出人体微生物群中存在哪种细菌的研究人员来说,纯肠道菌株的参考基因组数据库是至关重要的。然后,如果他们我想测试一个假设,例如某个特定物种在某种疾病中富集,如果这个物种看起来很重要,它们可以从分离物中获取分离物并在实验室进行物理测试。“
来自Wellcome Sanger研究所的资深作者Trevor Lawley博士说:“这种单个细菌的培养物集合将成为基因和转化微生物组研究的改变者。通过培养不成熟的细菌,我们创造了一种能够进行微生物组分析的资源。更快,更便宜,更准确,并将进一步研究其生物学和功能。最终,这将引导我们开发新的诊断和治疗疾病,如胃肠道疾病,感染和免疫状况。
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