新版人类蛋白质图谱

今天，推出了第15版人类蛋白质图谱。新版本包括来自不同来源的数据，这使得可以对RNA和蛋白质水平的组织谱进行比较。仔细观察人体组织或细胞中的健康和疾病状况，可以了解更多信息，从而改善医疗保健。为了进行这种比较，研究人员首先需要了解人体是如何建立的。一种方法是分析转录组。这意味着研究哪些基因被激活以在组织或细胞样品中产生蛋白质。

人类生物学分三个步骤构建; 从DNA到RNA再到蛋白质。需要将DNA代码复制到RNA中，然后读取以制作蛋白质。检测和计数蛋白质分子非常复杂，科学家们需要不同的方法来确保数据的有效性。一种方法是分析转录组以计算从特定基因的DNA中复制的RNA分子的量，从而产生从样品中期望的蛋白质的图片。计数RNA分子比计算蛋白质分子更容易。

人类蛋白质图谱包括基于超过25 000种针对超过17 000种独特蛋白质的抗体的蛋白质组分析，并结合涵盖所有20 000种人类蛋白质编码基因的转录组分析。4月11日发布的新地图集还包括来自多个来源的主要数据，可以进行比较。

- 人类蛋白质图谱的新版本在绘制不同人体组织中的转录组方面取得了显着进步。这些数据是我们在Chalmers进行的大部分代谢模型的基础。因此，我对这一进展感到非常兴奋，人类蛋白质图谱肯定会成为我们向更好的诊断和精准医学发展的重要资源，生物学和生物工程系的Jens Nielsen教授说。

此次发布会附有分子系统生物学的一篇文章，描述了转录组资源，重点是从Broad Institute，Boston，US(GTEx)和Human Protein Atlas生成的数据集之间的比较。与人类蛋白质图谱相比，GTEx数据集包括大多数重叠的1600个样本，但在某些情况下是独特的组织。已经包括来自28个GTEx组织的RNA-seq数据以及人类蛋白质图谱中的相应组织，以允许人类蛋白质图谱和GTEx数据集之间的直接比较。

- 将GTEx数据集纳入人类蛋白质Atlas数据库使其更加全面，并且令人放心的是，基于两个独立数据集的基因组织分类存在显着重叠，项目主任MathiasUhlén教授说。人类蛋白质图谱项目。

发表在Molecular Systems Biology上的文章讨论了公开可用的人类转录组资源以及这些数据库在各种应用中的可能用途，例如构建用于分析健康和疾病背景下的细胞和组织功能的基因组规模代谢模型。

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