遗传密码比我们想象的更加多样化
新研究对人们普遍认为细胞如何利用DNA制造蛋白质产生怀疑。
细胞采取了许多复杂的步骤,将它们的基本DNA构建模块序列转化为蛋白质,然后作为主力来发挥生命的重要功能。
由于许多不同的蛋白质在单个DNA链上编码,因此细胞使用标记物来知道何时开始和停止制造蛋白质。
许多生物学教科书都说开始标记,称为起始密码子,总是编码一种叫做蛋氨酸的化合物。
“我们团队的新研究表明教科书可能是错误的,”纽约州立大学布法罗分校的结构生物学家William Duax博士说。
“我们有充分的证据表明,数百种最古老的核糖体蛋白仍然以缬氨酸或亮氨酸编码开始,并且DNA中没有甲硫氨酸的密码子,”杜克斯博士说,他指的是在称为核糖体的基本细胞成分中发现的蛋白质。
“我们已经发现了明确的证据,表明地球上最早的物种仍在使用原始形式的遗传密码,只有标准的64个密码子的一半。”
结果与生物学家普遍持有的观点相矛盾。
“教科书中存在重大错误,”杜克斯博士说。
“通用代码并不普遍,现在地球上的所有物种都没有像沃森和克里克所说的那样使用'及时冻结'的代码。”
“关于进化的一些基本假设是不正确的。”
“结果提出了关于生命起源假设的某些方面的问题,称为RNA世界,它假定RNA类似于DNA,仍然在细胞中使用,是第一种遗传物质。”
Duax博士和共同作者通过一个包含超过9000万个基因序列的数据库进行梳理,获得了他们的结果。
这些基因编码蛋白质,团队使用新技术准确识别每个蛋白质家族的所有成员,并将其与所有其他未保持30亿年不变的家族区分开来。
科学家们开发了一些程序来加速完整捕获并完美排列具有25,000个成员的蛋白质家族,并涵盖报告基因组的所有物种。
从那些完美的比对中,生物学家可以确定比对中最保守残基的精确位置和功能,这意味着蛋白质在最长的时间内保持不变。
从这些原始蛋白质中,研究小组发现了最古老的蛋白质不是以标准方式开始或使用标准代码的许多其他部分来制造蛋白质的证据。
除了改变我们研究遗传编码和重写教科书的方式之外,这项工作还应用于遗传疗法,利用细菌的结构细节来开发具有选择性且副作用较少的疗法。
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