研究人员的大山雀序列基因组
一个国际科学家团队,从生态学的荷兰研究所Martien Groenen博士瓦赫宁根大学的纯美莱恩博士的带领下,已测序和组装某知名鸣禽的基因组中,大山雀(大山雀)。
Laine,Groenen博士及其来自美国,欧洲和日本的同事从荷兰的一个圈养种群(圈养了四代)中选出了一只雄性大山雀进行基因组测序和组装。
为了进一步了解该物种的进化遗传学,他们还对整个欧洲另外29个野生个体的完整基因组进行了测序。
“ 50多年来,大山雀一直是进化,生态和行为研究的典范物种;特别是学习和认知得到了深入的研究。”
“为了进一步了解这些重要特征背后的分子机制,我们从头开始组装一个巨大的山雀参考基因组,并对全欧洲的另外29个人进行全基因组重测序。”
除了研究大山雀的基因组外,该团队还通过在参考鸟的大脑和血液组织中进行全基因组测序研究了DNA甲基化模式。
科学家解释说:“甲基化属于表观遗传学领域–研究可以在基因中而不是在基因上遗传的内容。”
“基因组中的特定DNA序列可以被甲基化:甲基被添加到它们中,从而改变了基因的功能。”
“这使我们能够识别大山雀基因组中在鸟类最近进化过程中处于选择状态的区域。”
对于与学习和认知有关的基因,这些区域似乎被过度代表。
来自荷兰生态研究所的团队成员Kees van Oers博士说:“ 山雀已经变得聪明,非常聪明。”
“这不是您的平均鸟类,因为它在学习新行为方面属于最聪明的3%鸟类。这使其成为研究学习,记忆和认知过程进化的理想人选。”
“研究表明,在那些相同的区域中,所谓的甲基化保守模式不仅存在于鸟类中,而且还存在于人类和其他哺乳动物中。”
这证明了甲基化等表观遗传过程与分子进化速率之间的相关性:“甲基化越多,进化就越多。”
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