追踪非小细胞肺癌的演变

在非小细胞肺癌(NSCLC)患者中，有关肿瘤内异质性和癌症基因组进化的数据仅限于小型回顾性队列研究。我们希望前瞻性地研究与临床结果相关的肿瘤内异质性，并确定早期NSCLC中驱动程序事件和进化过程的克隆性质。

方法

在这项前瞻性队列研究中，我们对系统治疗前已切除的100例早期NSCLC肿瘤进行了多区域全外显子组测序。我们对327个肿瘤区域进行了测序和分析，以定义进化史，获得克隆和亚克隆事件普查，并评估肿瘤内异质性与无复发生存率之间的关系。

结果

我们观察到广泛的肿瘤内异质性的体细胞拷贝数变化和突变。EGFR，MET，BRAF和TP53中的驱动程序突变几乎总是克隆的。但是，在进化的后期发生的异质驱动程序改变在超过75%的肿瘤中发现，并且在PIK3CA和NF1以及染色质修饰，DNA损伤反应和修复中涉及的基因中很常见。基因组加倍和持续的动态染色体不稳定与肿瘤内异质性相关，并导致驱动体细胞拷贝数改变的平行进化，包括CDK4，FOXA1和BCL11A的扩增。拷贝数异质性升高与复发或死亡的风险增加相关(危险比，4.9; P = 4.4×10 -4)，这在多变量分析中仍然显着。

结论

通过染色体不稳定性介导的肿瘤内异质性与复发或死亡的风险增加相关，这一发现支持染色体不稳定性作为预后指标的潜在价值。