新工具可能会加速抗体 疫苗研究
得益于范德比尔特大学研究人员及其同事开发的新工具LIBRA-seq,抗体发现和疫苗开发研究领域可能即将迅速扩展,以前需要数十年才能获取的数据。
目前,由于技术的限制,从白血球产生的数十亿种抗体(称为B细胞)中鉴定出一种抗体,可能会花费长达一年的时间,这种抗体可以发展成为识别并攻击抗原的抗原标记的药物。特定病原体。
伊恩赛特利夫,一个研究生在Ivelin Georgiev的,博士的实验室,在范德比尔特疫苗中心,不知道是否有可能同时映射和高吞吐量的方式抗体序列和抗原特异性。
乔治·耶夫说:“这似乎是一个疯狂的主意,这很可能行不通。” 但是塞特里夫的概念确实起作用,并导致在短短几周内发现了一种新型的抗HIV抗体。
LIBRA-seq的开发和验证,代表通过测序将B细胞受体与抗原特异性连接,最近在《细胞》杂志上进行了描述。
范德比尔特大学医学中心病理学,微生物学和免疫学副教授,范德比尔特大学计算机科学副教授Georgiev说:“通常,“很难知道何时只有抗体序列,该抗体的抗原特异性是什么”。大学工程学院。
范德比尔特大学的研究人员与杜克大学医学院,马萨诸塞州总医院,南非约翰内斯堡的威特沃特斯兰德大学以及美国国立卫生研究院的同事合作,为这项工作提供了支持,他们首先通过对已知细胞系的LIBRA-seq进行验证。 B细胞受体。
然后,他们开始进行前瞻性抗体发现,该发现确定了先前未知的针对人类免疫缺陷病毒(HIV)的广泛中和抗体的谱系,而该病毒会导致AIDS。
范德比尔特(Vanderbilt)研究生安德里亚·夏科拉斯(Andrea Shiakolas)说:“该方法确实有助于发现,因为我们能够使用比其他筛选方法更大的筛选库。”
Georgiev说,范德比尔特的多机构合作和可用资源使复杂的项目成为可能。
这些资源包括范德比尔特高级基因组学技术(VANTAGE),VUMC的核心基因组学实验室,医学中心的流式细胞术共享资源以及大学的研究与教育高级计算中心(ACCRE)。
Georgiev表示:“我们很幸运能够在范德比尔特以及范德比尔特以外的地区进行出色的合作,” Georgiev强调了VANTAGE测序核心的资源对于项目的成功至关重要。
该团队希望LIBRA-seq将成为一种变革性技术,并将对基础研究和应用研究产生直接影响。他说:“这使我们能够开始提出很多以前无法提出的问题。”
Georgiev补充说:“我们开始研究HIV感染和疫苗接种领域的新靶标,但我们也对抗体如何识别抗原的基础生物学感兴趣。” “这项技术将帮助我们产生更多的数据,我们将能够挖掘这些数据来开始解决这些问题。”
研究人员说,LIBRA-seq有潜力帮助研究人员缩小搜索范围,以找到可能对人类健康产生深远影响的目标。
他们说,这一壮举可与试图从构成宇宙的数十亿个中找到一些特殊的恒星相比。毕竟,天秤座的名字是受天文学星座天秤座启发的。
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