研究人员在干细胞分化时跟踪DNA修饰和基因表达
表观遗传修饰在细胞分化中起主要作用,有助于确定哪些基因在不同的细胞系中转录。但是在发育过程中很难观察到胚胎个体细胞的DNA。上周(5月9日)发表在 Cell上的论文随着胚胎干细胞的分化而发表,表明细胞根据其发育阶段表现出不同的表观遗传修饰。
研究人员诱导人类胚胎干细胞分化成四种不同的细胞类型:中胚层,它将成为胚胎组织的中间和内层; 滋养细胞样细胞,滋养胚胎,帮助形成胎盘; 间充质干细胞,分化为骨和软骨; 和神经祖细胞。他们记录了在不同分化阶段在每种细胞中转录的基因,并测量了染色质重塑和DNA甲基化。
他们发现,在早期发育过程中,表达的基因往往处于“DNA甲基化谷”,或者核苷酸鸟嘌呤和胞嘧啶中含量非常丰富,甲基化程度低。在这个阶段,染色质重塑是最重要的表观遗传调控类型,而甲基化则不太重要。在后期开发中,关键发育基因的启动子往往在鸟嘌呤和胞嘧啶中较差并且受甲基化调节。
“关于干细胞如何分化成不同细胞类型的表观基因组学研究是了解动物早期发育的一种很好的方法,”Salk研究所植物分子和细胞生物学实验室主任,该论文的作者Joseph Ecker在新闻稿中说道。。“如果我们了解这些细胞的谱系是如何产生的,我们就可以理解在分化过程中是否出现了正确与错误。这是一项非常基础的研究,但是能够为各种疗法生产优质细胞类型具有意义。“
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