新的数字方法增强了对DNA化妆变化的理解

科学家已经开发出一种计算方法来检测DNA中的化学变化，突出细胞多样性，并可能更好地了解癌症。在欧洲研究中，发表在核酸研究和纽卡斯尔大学，专家们建立了一种生物信息学方法，可用于造血，即干细胞血液形成的过程。

关于如何在我们体内形成不同细胞的信息在我们的基因组中编码，该基因组由DNA的四个字母组成。每种细胞类型的特征在于其独特的表观基因，一个化妆即离开基因组的“打开”或“关闭”不同部分许多不同的蛋白质组成的基因组的。

使用不同的化妆品，一个人的相同基因组可编码必要的信息，以发展所有不同的组织和器官。开发的新方法允许自动分析多个表观基因组，以确定必要的化妆变化形成健康和患病细胞类型的基因组位置。

疾病生物标志物

纽卡斯尔大学细胞医学研究所研究员丹尼尔里科博士说：“我们有技术来揭示不同的表观基因组成，这产生了大量的数据。

“我们可以认真谈论表观基因组学研究中的”大数据“。然而，主要的瓶颈是将所有这些数据转化为有用的信息，以深入了解生物机制。

“我们开发的新方法将使研究人员能够识别基因组中的关键区域，这些区域根据细胞类型显示差异化妆。

“由于许多疾病与疾病特异性表观基因组成有关，因此该方法对于鉴定化妆品偏离健康状态的基因组中的关键区域特别有用。

“这将有助于开发新的疾病生物标志物，并希望为开发针对表观基因组的疗法开辟新的道路。”

该方法允许整合各种表观基因组数据集以对不同样品进行分类并自动识别其中变化影响细胞类型定义的基因组区域。

基因组化妆

人类基因组是一个沉闷的字母序列，但由于表观基因组的帮助它变得活着。

基因组就像一本书，其中字母相互跟随，没有空格，句号或逗号。读这本书是非常困难的，完全不可能理解它。

然而，通过简单地添加标点符号，我们可以阅读并理解那些明显无聊的字母序列的含义。

这是表观基因组完成的一项重大任务，它由DNA上的化学变化组成，使我们和细胞能够理解如何阅读和解释基因组。

出于这个原因，研究表观基因组对于理解发育如何产生形成组织和器官的多种细胞类型非常重要，所有这些都是从单个细胞和单个基因组开始的。

表观基因组还经常参与解释健康细胞在恶性转化后如何产生肿瘤。但是，尽管迄今为止可获得的数据集合，定位基因组中具有化学变化和变化类型的那些区域仍然是一个挑战。

这些化学变化在发育期间和整个生命过程中产生，作为外部因素的影响，例如生活方式，它们可以引发癌症等疾病。识别表观遗传学生物标志物是实现新的诊断和治疗选择的基础。

考虑到基因表达水平作为生物标志物，使用它们的开/关状态，已经广泛使用分子分类。

这种方法可以让研究人员识别那些参与调节开/关基因状态的区域，如生物开关。这些区域可用作表观遗传生物标志物，补充实际的分子分类。

重要的发展

该项研究的共同第一作者，来自西班牙国家癌症研究中心的Enrique Carrillo-de-Santa-Pau说：“这种方法的发展非常重要。

“到目前为止，细胞类型之间的差异主要表现在开启或关闭的基因水平，这是表观基因组调控的最终产物，但我们不知道这些基因的开关在哪里(编码于的表观基因组)。

“这种获得的知识对于在细胞失去对癌症等疾病的控制的情况下基于正确开关的新疗法是至关重要的。

“了解这一级别的监管将使我们在个性化医疗议程中更进一步。”

希望这种方法能够让科学家识别新的表观遗传生物标志物，这些生物标志物可用于个性化医学的诊断和治疗。

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