疾病的蛋白质组学分析
在初诊后5年内,只有四分之一的人被诊断出患有急性髓性白血病(AML)。为了提高存活率,德克萨斯州的研究人员创建了一个在线地图集,用于识别和分类AML诊断中的蛋白质特征。新的蛋白质分类将帮助研究人员和临床医生为患有这种侵袭性癌症的患者推荐更好的治疗和个性化药物。这项突破性研究于本周在Nature Biomedical Engineering上发表。
美国德克萨斯大学圣安东尼奥分校的共同资深作者Amina Qutub表示,AML发生在血液和骨髓中,并且“呈现出如此异质的癌症,通常被描述为不是一种疾病,而是一系列疾病”。
研究人员检查了由于AML引起的癌细胞中发生的遗传,表观遗传和环境多样性。通过分析205例患者活组织检查的蛋白质组学筛选,他们开发了一种名为MetaGalaxy的新计算方法,用于鉴定白血病的分子标志,并根据细胞功能和途径将蛋白质特征分为154种不同的模式。
通过从血液和骨髓中的蛋白质表达开发每个白血病患者的定量图谱的独特镜头来接近这一挑战,而不仅仅是定性指标和遗传风险的标准镜头,该团队将能够更精确地对患者进行分类进入风险群体并更好地预测他们的治疗结果。“这些标志类似于星座引导恒星导航的方式:它们提供了白血病蛋白质变化的图谱,”Qutub说。
为了更好地理解蛋白质组水平的AML标志并与其他研究人员分享他们的工作成果,该团队建立了一个名为白血病蛋白质组图谱的门户网站。该在线门户网站为肿瘤学家和癌症科学家提供了从一名患者到另一名患者研究AML蛋白表达模式所需的工具。它还为世界各地的研究人员提供新的白血病研究和新计算工具的线索。
由于许多基因突变不能被靶向,因此本研究中使用的蛋白质组学分析和靶标识别过程将加速治疗靶标的鉴定。它还推动研究人员根据其独特的蛋白质特征为患者开发个性化的联合疗法。
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