确定了金鱼草花色差异的基因
金鱼草是高大,迷人的植物,花朵色彩鲜艳。在西班牙,snapdragons野生生长,这些花的颜色显示出一种非凡的模式:当从巴塞罗那到比利牛斯山脉的道路上行驶时,金鱼草品种的金鱼草在道路开始时在洋红色开花,然后是一群黄色的开花金鱼草仅花了两公里长的花朵,花色混合在一起。这种金鱼草的混合区很少见; 只有少数人知道。
但为什么金鱼草混合在一起,黄色和洋红色的花朵在广阔的区域一起生长?奥地利科学技术研究所(奥地利IST)的尼克巴顿,以及曾在巴顿小组担任博士后大卫大卫菲尔德,现任维也纳大学助理教授,与诺维奇John Innes中心的分子遗传学家合作调查原因这种模式。科学家们在今天的PNAS版中写道,他们从DNA序列数据中发现了导致花色差异的基因。
“DNA测序变得越来越便宜。但分析序列数据和解释模式非常困难,”Nick Barton解释道。“在这项研究中,我们使用来自金鱼草植物的序列数据来定位导致杂交区域花色差异的各个基因。” 研究人员比较了每种颜色的50种金鱼草的基因组序列,并测量了品红色和黄色金鱼草种群之间序列的分布程度。通过绘制两个群体之间差异的统计量度,他们发现基因组中的“岛屿”在黄色和洋红色金鱼草之间比基因组的其他部分更加不同。在金鱼草中,这些岛对应于负责花色的基因。
如何保持黄色和洋红色种群之间的明显差异是博士学位的主题。汤姆埃利斯在尼克巴顿实验室的论文。通过田间和IST奥地利实验的观察,他发现蜜蜂喜欢为人群中最常见的花色授粉:在洋红色种群中,蜜蜂主要授粉洋红色花; 在黄色种群中,蜜蜂主要授粉黄色花朵。这种选择有利于最常见的类型使混合区域保持清晰,并防止与花色基因相关的基因的交换。
在目前的研究中,研究人员想知道两个金鱼草种群如何变得不同。他们发现了两种原因,即金鱼草种群在花色基因上发生分歧。首先,选择有利于颜色基因的新变种,使花对蜜蜂更具吸引力 - 导致这些基因扫过群体,并在DNA序列中留下尖锐的信号。其次,花基因成为基因交换的障碍。位于花基因附近或甚至之间的任何基因都不容易在群体之间交换,因此确定花色的基因周围的基因组区域变得不同。
“即使有丰富的DNA 序列数据,通常很难找到物种不同的确切原因。我们的研究是多年工作的结晶,将田间工作和群体遗传学与遗传杂交相结合,并对基因表达进行分析,”Nick Barton解释说。
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