更多古老的病毒隐藏在我们的DNA中 而不是我们想象的
认为你的DNA是全人类吗?再想想。一项新发现表明,它比科学家先前所认为的人类更少。刚刚在我们自己的基因之间发现了19种新的非人类DNA,这些DNA是由数十万年前首次感染我们祖先的病毒留下的。研究人员在美国国家科学院院刊上发表研究结果的科学家表示,在所研究的2,500人中约有50人中发现了一段新发现的DNA,它包含完整的完整病毒基因配方。
它是否可以复制或复制,目前尚不清楚。但是对古代病毒DNA的其他研究表明它可以影响携带它的人类。除了发现这些新的延伸,科学家还证实了近年来其他科学家在人类基因组中发现的17种其他病毒DNA 。
该研究考察了来自世界各地的人们的DNA或基因组的整个范围,其中包括来自非洲的大量数据 - 现代人类的祖先在世界各地迁移之前就已经发源。该团队使用复杂的技术将每个人基因组的关键区域与“参考”人类基因组进行比较。
研究人员在塔夫茨大学和密歇根大学医学院工作,并在国立卫生研究院的资助下完成了研究结果。
HERV-enly找到
这些发现增加了科学已经知道的人类内源性逆转录病毒或HERVs。这就是古代传染病毒的名称,它将自己的RNA遗传物质的基于DNA的拷贝插入到我们的祖先的基因组中。它们是包含导致艾滋病的现代人类免疫缺陷病毒的同类病毒的一部分。
经过几代人的努力,病毒产生的DNA在人类复制时不断被复制和传播。这就是它今天在DNA中的结果。事实上,我们认为“人类”DNA的大约8%实际上来自病毒。在某些情况下,HERV序列已被人体采用以达到有用的目的,例如帮助孕妇的身体在发育中的胎儿周围建立细胞层以保护其免受母体血液中毒素的影响。
新的HERV是HERV-K家族的一部分。刚刚发现的完整的全病毒基因组或原病毒是在X染色体上; 它被称为Xq21。它只是发现隐藏在人类DNA中的第二个完整原病毒。
用研究人员自己的话说:
“这个看起来像它能够产生感染性病毒,如果这是真的很令人兴奋,因为它可以让我们研究很久以前发生的病毒流行病,”资深作者和病毒学家John Coffin博士说。塔夫茨大学医学院。“这项研究提供了理解逆转录病毒和人类近来如何共同进化所必需的重要信息。”
“许多研究试图将这些内源性病毒元素与癌症和其他疾病联系起来,但一个主要困难是我们还没有真正找到所有这些疾病,”共同第一作者Zachary H. Williams博士说。 。波士顿塔夫斯大学萨克勒大学生物医学科学学院的学生。“许多最有趣的元素只能在一小部分人中找到,这意味着你必须筛选大量的人才能找到它们。”
“这是一个惊心动魄的发现,”共同第一作者,博士Julia Wildschutte博士说,他开始了博士学位。学生在塔夫茨的棺材实验室。“它将为研究打开许多大门。更重要的是,我们在本文中已经证实,与参考人类基因组相比,我们可以使用来自多个个体的基因组数据来检测新的HERV。但这也向我们证明了一些人进行插入我们无法映射回参考。“
UM遗传学研究员杰弗里·基德博士与Wildschutte合作,当时她是实验室团队的成员。基德说:“这些是古代事件的残余,这些事件并未在整个人口中得到修复,而是发生在今天活着的一些人的祖先身上。” “有许多其他HERVs将自身插入人类基因旁边或靠近它们,并对其表达产生影响。我们有兴趣应用这些方法来寻找其他类型的病毒或移动元素插入。”
基因团队合作
密歇根小组使用方法来表征Kidd和他的团队开发的重复DNA序列,而Coffin和Williams则采用了互补技术。Wildschutte现在在鲍灵格林州立大学。
他们检查的许多基因组来自1000 Genomes Project,这是一项国际合作。另一组基因组来自于斯坦福大学的Kidd及其同事作为人类基因组多样性项目的一部分,其重点是来自非洲志愿者的DNA样本。
后面的这些样本显示出更多的HERV迹象,与非洲人群的高水平遗传多样性一致。这种多样性源于非洲大陆人口的长期稳定和混合 - 而不是欧洲,亚洲和美洲的其他人口,这些人口源于古代特定的迁徙。
对人类中的所有HERV插入进行编目将需要对整个人类基因组进行更多扫描,随着技术的改进和变得更便宜,这些基因组变得越来越容易。虽然潜伏在我们DNA中的完整原生动物可能很少见,但其他HERV序列对我们的健康或疾病的影响可能不大。
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