城市有个体微生物特征
根据一项新的研究,城市有自己独特的微生物群落,但这些社区在同一城市的办公室之间差异不大。这项工作于本周发表在美国微生物学会的开放获取期刊mSystems上,可以深入了解建筑环境中微生物成分的驱动因素。这项研究由位于弗拉格斯塔夫北部亚利桑那大学的三个北美城市的办公室进行的微生物采样也发现,人体皮肤对建筑环境表面的成分有很大影响,办公室地板比其他表面有更多的微生物,可能是因为从工人的鞋子里堆积的土壤和其他材料。
“我们怀疑,在没有极端条件如洪水的情况下,微生物可能被动地积聚在建筑环境中的表面而不是经历一个活跃的过程,”高级研究作者J. Gregory Caporaso博士说,他是生物科学和生物科学的助理教授。该大学微生物遗传学和基因组学中心助理主任。“随着我们继续扩大对建筑环境微生物学的理解,可能包括对微生物群落的常规监测,以追踪可能影响人类健康的变化,我们的研究结果将有助于为未来的研究工作提供信息。”
为了了解微生物在建筑环境中如何在一段时间内建立起来,Caporaso及其同事在以下每个城市监测了三个办公室:弗拉格斯塔夫,圣地亚哥和多伦多。在每个办公室,他们安装了三个采样板,每个采样板在地板,天花板和墙壁上; 每个板包含两个或三个样品,每个样品都是涂漆的干墙,天花板和地毯,以及允许它们监测环境参数的传感器,包括样品表面上的平衡相对湿度,可用光,占用率和温度。在四个六周的采样周期中收集样品,每季一个。然后,他们使用称为16S rRNA基因测序和ITS-1的实验室技术来分析样本中发现的细菌和真菌群落。
该团队发现,无论材料含有多少微生物而不是墙壁或天花板表面,地板样品; 频繁取样的试验板只能轻微破坏微生物群落; 并且城市有自己的标志性微生物群落。“这特别有趣,因为即使在每个城市,我们研究的办公室在规模,使用模式和通风系统方面也各不相同,”Caporaso说,“这表明地理位置比推动这些特征更重要。在我们研究的范围内的办公室的细菌群落组成。“
弗拉格斯塔夫办事处的微生物群落比圣地亚哥或多伦多的微生物群落更为丰富,虽然卡波拉索说不清楚原因。
为了确定任何特定的办公室工作人员或身体部位是否是办公室中看到的微生物的来源,研究人员还从弗拉格斯塔夫办事处的一名工作人员和执行抽样的个人那里收集了人类皮肤,鼻腔,口腔和粪便微生物组样本。所有三个城市的技术。
在所有九个办事处中,该团队发现人类皮肤细菌群落是办公室细菌群落样本的最大可识别来源,其中至少25-30%的办公室表面微生物群来自人体皮肤。人类鼻腔微生物组似乎也是办公室表面微生物群落的一个小但一致的来源。然而,这些办事处中最大的微生物群落来自非人类来源,如环境。
研究人员发现,收集的办公室微生物与室内环境变量(如温度或湿度)之间没有显着关联。
该团队接下来将模拟洪水事件,以检查建筑环境中的真菌群落如何随时间而变化。
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