多组学方法提供了有关花生过敏严重程度的新见解
西奈山伊坎医学院的研究人员已经确定了与花生过敏严重程度相关的新基因,以及这些基因在过敏反应中与其他基因相互作用的方式。
该发现于12月12日发表在《变态反应与临床免疫学杂志》上,可能会导致对花生变态反应的更好治疗。
花生过敏的严重程度差异很大,是致命的与食物相关的过敏反应的主要原因。用于确定是否存在花生过敏的测试无法提供任何有关摄入花生的人是否会出现轻度皮疹,严重肿胀或危及生命的问题(如呼吸困难或心血管并发症)的任何线索。
该研究的资深作者Supinda Bunyavanich医学博士,医学博士,遗传学和基因组科学与儿科学副教授,西乃山埃利奥特和罗斯林·贾菲食品过敏研究所副所长,特别好奇为什么反应的严重性如此变化。无论是作为临床科学家还是对花生过敏的孩子的母亲,都是如此。
为了帮助解决这个问题,Bunyavanich博士和她的团队使用了新颖的多组学方法(对给定分子类型的系统范围测量的作用,关系和作用进行研究),以鉴定可能加剧了花生过敏反应的严重性。这些方法包括转录组学,跨基因组的基因表达研究和表观基因组学,影响基因表达的DNA可逆修饰研究。
该研究涉及21位7至17岁的花生过敏儿童,他们逐渐增加剂量的花生直至表现出过敏反应。科学家分三次从参与者身上抽血:进食前,反应时和反应后。研究小组通过在另外19名儿童中重复这项研究,证实了他们最初的研究结果。
随着孩子们的反应,该团队多次采集血样可以分析转录组和表观基因组(可以告诉科学家哪些基因是通过称为甲基化的过程打开或关闭的)。使用这种全基因组方法,他们确定了300多个与反应严重程度相关的基因和200个CpG位点(DNA可以通过甲基化被激活或失活的区域)。该团队使用整合网络将这些数据结合在一起,还描述了基因表达,CpG位点和反应严重性之间的关键相互作用。
他们不仅确定了与花生过敏严重程度有关的新基因,而且还设法表征了这些基因在变态反应过程中与其他基因和CpG位点相互作用的方式,以调节生物过程。该研究的主要作者,邦尼瓦维奇实验室的博士后研究员Anh Do博士说:“ 应用多组学方法揭示基因和甲基化位点如何相互作用以影响这些花生过敏性孩子的反应严重程度,这非常令人兴奋。” 。
在这些见解中,有一项发现是,尽管这些发现支持了变态反应中适应性免疫的公认作用,但他们还表明,中性粒细胞(一种白细胞)介导的免疫在反应严重性中起着重要作用。Bunyavanich博士说:“我们知道中性粒细胞介导的免疫是免疫反应的一部分,这项研究表明它可能在花生过敏反应的严重程度中起着核心作用。”
此外,研究小组确定的一种反应严重程度驱动因素之一,即ARG1基因,可被精氨酸酶抑制剂抑制,精氨酸酶抑制剂是一种正在研究中的多种疾病药物。这项研究的发现表明,它也可能是治疗花生过敏的潜在靶标。
Bunyavanich博士希望未来的研究能够识别出一些生物标志物,这些标志物可以预测谁可能有严重的反应而不必先将其暴露于花生。但与此同时,她指出,这项研究“希望能从更大的角度挑战人们思考食物过敏 ”。
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