国际人类细胞图谱公布了战略蓝图宣布了首百万个细胞的数据
人类细胞地图集(HCA)联盟发布了国际计划努力创建所有人体细胞综合参考图的蓝图,该项目将成为更深入了解人类健康以及诊断,监测和治疗的基础。疾病。蓝图的发布 - 作为白皮书发布到HCA网站 - 恰逢HCA组织委员会发表了一篇自然评论,总结了该联盟的愿景和使命。
此外,该联盟今天还宣布即将从HCA收集的第一百万个免疫细胞中释放基因表达谱,最初的里程碑是收集代表几个组织和器官的至少3000万个细胞用于地图集的初稿。这些数据将于11月初发布在在线资料库中,供研究人员免费使用。
蓝图和数据发布在由以色列雷霍沃特的魏茨曼科学研究所主办的第二届HCA大会上发布。会议庆祝财团成立一周年,标志着其从规划到运营阶段的正式过渡。
“在过去的一年里,国际科学界,从医生到计算机科学家,已经参与了一个开放的过程来计划如何制作这个革命性的地图集,”Aviv Regev说,他是核心成员,教职员和主任。麻省理工学院和哈佛大学布拉德曼细胞观察站和细胞电路计划;一名HHMI调查员;麻省理工学院生物学教授;与HCA组委会的Wellcome Trust Sanger Institute的Sarah Teichmann共同主持。“我们一起画了蓝图。现在是时候开始建房了。”
“完成时将为地图集收集的数据将为更深入研究细胞功能和相互作用提供切入点,无论是在其家庭组织内还是更广泛地在整个身体内,”细胞遗传学负责人Teichmann说。桑格研究所,剑桥大学物理系研究主任,剑桥丘吉尔学院高级研究员。“随着时间的推移,这些知识将对人类生物学和人类健康的科学理解产生变革性影响。”
全球战略蓝图
HCA于2016年启动,目标是人类基因组计划的范围雄心勃勃:创建所有人体细胞的参考目录,其比例,位置以及它们之间的相互作用。白皮书指出,对于地图集的初稿,该联盟将使用大规模平行的单细胞RNA测序(一套能够鉴定基因的基因组技术)研究和绘制来自选定器官和组织的3亿至1亿个细胞。一次成千上万个细胞中的表达谱,用于表征其他分子的相关技术,以及用于绘制细胞位置和相互作用的空间方法。
该联盟的长期目标是分析至少100亿个细胞,覆盖所有组织,器官和系统,代表健康组织以及受特定疾病和病症影响的组织。完整的地图集将尽可能多样化,捕捉一系列疾病,地理位置,环境和年龄组。
治理
除了确定地图集初稿的目标和范围外,白皮书还概述了财团的组织和治理结构,重点强调科学多样性和包容性。它还提供了一套以道德,公平和开放为基础的指导原则,反映了财团的科学基层起源。
HCA由HCA的决策机构组委会(OC)指导和管理。该OC由来自10个国家的27名科学家组成,目前由Aviv Regev(Broad Institute)和Sarah Teichmann(Wellcome Trust Sanger Institute)共同担任主席。在此处查看HCA领导的完整列表。
“HCA是由科学家构思和发起的,它由来自10个国家的19个机构的科学家管理和管理,”日本RIKEN(物理和化学研究所)基因组技术部门主任Piero Carninci说。和RIKEN生命科学技术中心副主任。“来自世界各地的数十位科学家,包括亚洲各国,已经表达了他们对参与HCA研究并为其提供专业知识的兴趣。”
数据来自第一百万个细胞,并且路径达到了一百亿个
今天宣布的免疫细胞表达数据将于11月初在公共在线资源中提供,包括从骨髓和健康人类供体的脐带血收集的大约一百万个细胞的单细胞RNA表达谱。
该表达数据将免费提供,允许科学界成员在研究中使用该信息。对开放获取的承诺是HCA的核心价值之一,以及关键的道德考虑因素。
人类细胞图谱(HCA)是一个国际合作联盟,旨在创建所有人类细胞的全面参考图- 生命的基本单位 - 作为理解人类健康和诊断,监测和治疗疾病的基础。HCA是一种基础的,开放的资源,用于绘制全身的细胞,组织,器官和系统。HCA将影响生物学和医学的各个方面,推动翻译发现和应用,并最终开创精准医学的新时代。
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