遗传学家发现两种不同的转录终止模式

Helge Grosshans和他在弗里德里希·迈歇尔生物医学研究所(FMI)的研究小组已经确定了两种不同的转录终止模式 - 一种依赖于高度保守的外切核糖核酸酶XRN2，一种独立于此。在湿实验室和计算生物学家之间的富有成效的合作中，他们发现基因的启动子决定了其转录终止的机制。

当遗传信息从DNA转录为RNA时，重要的不仅是过程开始的地方，还有停止的地方。终止失败导致相邻基因“通读”，破坏其调节或产生浪费且可能有害的融合转录物。但是，正如FMI集团领导人Helge Grosshans所指出的那样，“转录终止主要是一个黑盒子;除了对一种称为外切核糖核酸酶2(XRN2)的蛋白质重要性的新兴共识外，对相关因素和机制知之甚少。”

Grosshans和他的小组现在已经详细研究了蛔虫秀丽隐杆线虫(Caenorhabditis elegans)的转录终止。他们的研究结果发表在Genes&Development杂志上。

在他们的研究中，科学家们研究了灭活XRN2的影响。他们发现转录未能在许多基因的末端终止 - 正如预期的那样。然而，出乎意料的是，对于许多其他基因，终止正常发生。Grosshans评论说：“我们的研究结果表明，一些基因需要XRN2进行终止，而其他基因则没有。事实上，后者的转录似乎难以通过XRN2活性终止。”

对这两类基因的进一步分析揭示终止模式由基因启动子指定。Grosshans解释说：“这是一个很大的惊喜。启动子与转录起始位点相邻，决定转录开始的时间和地点，而终止发生在基因的远端。我们原本期望找到决定终止模式的因素。终止位点本身;相反，XRN2终止转录的能力已经被启动子指定。“

基于这一观察结果以及XRN2与两类基因结合的事实 - 那些需要终止的基因和那些不需要基因的基因 - 科学家提出了两种转录终止作用模式。在第一种模式中，XRN2与基因末端的转录机制的相互作用使该机器与DNA解离，释放转录物。在第二种情况下，转录机制的组成或构型可能不同，从而阻止XRN2破坏其与DNA的相互作用。终止是其他分子过程的结果。

Grosshans得出结论：“我们的研究结果是更好地理解转录终止的第一步。现在要回答的一个主要问题是哪些因素会导致XRN2独立终止。”

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