寻找与行为相关的基因的新指南
有兴趣寻找影响人类和动物行为的特定基因的科学家们有了一个新的工具,这要归功于为期两年的研究工作,旨在描述如何将最新的分子基因组学技术应用于复杂行为的研究。
“当你进入基因组学时,学习曲线非常陡峭,如果你从一个知识匮乏的地方开始,那将是非常令人生畏的,”莱斯大学行为生态学家萨拉·本斯顿说,他是一篇新评论文章的主要作者。行为科学家的基因组工具。
“我是需要这篇论文的人,”本斯顿说,他是赖斯生物科学系生理学和进化生物学的赫胥黎教授研究员。“我需要一个新手级的介绍,如何基因组工具可以帮助我回答研究问题。例如,我的实验设置是一个适用于基因组测序或任何分子技术的系统吗?我找不到那种参考所以我和一群非常聪明的人一起写了一篇。“
这篇文章本周出现在“自然生态学与进化论”(Nature Ecology and Evolution)中,旨在指导任何学科的行为科学家,提出关于基因组学工具是否适合他们研究的具体建议,如果是这样,哪些工具可能最适合他们的实验室工作。
Bengston说她在2015年完成研究生学习后不久就开始努力学习如何将基因组学研究纳入自己的研究项目。她曾在罗切斯特大学获得国家科学基金会(NSF)博士后奖学金,并试图建立自己的研究项目。
“行为连接了很多领域,”她说。“如果你是一位进化生物学家,生态学家,神经生物学家或心理学家,那么行为变异对你来说本身就很有趣。例如,为什么有些人比其他人更具攻击性?为什么我们经常会看到更高层次的攻击性还有更多的探索性?我们已经研究过这些问题多年了,我们知道其中很多都是遗传特征,但我们倾向于止步于此。“
Bengston在伊利诺伊大学厄本那 - 香槟分校听说了NSF关于基因组学和行为生态学的研讨会。
“我已经基本知道什么对我不起作用,因为我已经尝试了很多次而且失败了,”她说。“我走进那个研讨会,希望有人能指出我这篇新手级的入门书。”
相反,她在行为和基因组学方面找到了一个充满志同道合的专家的房间,他们致力于运用他们的专业知识来理解行为变异。该小组决定系统地解决这个问题。
“我们深入研究基因组学领域,将可用工具分解为类别,并将这些工具与一些反复出现的重大行为问题配对,”Bengston说。“我们产生了大约30个关于如何应用这些工具的假设,然后我们提出了使用可用工具解决这些假设的方法。”
该小组还发现,行为主义者需要更加积极地注释基因组以及与注释基因组的非行为主义者合作。
“没有行为友好的基因库,因为它不是注释这些基因组的行为主义者,”她说。“如果行为主义者进行转录测序并进入其中一个基因库,并且说'我对所有这些基因进行了点击',那么这个搜索很容易回归到一个与细胞有关的几十个基因的列表中。像膜转移的功能。
“这可能是因为注释基因组的人只关注细胞功能。没有任何东西可以帮助行为主义者理解,'好吧,这可能是一种细胞功能基因,但它也对行为产生重大影响。'”
Bengston说,对行为生态学家的基因组工具的审查已经在她自己的实验室中获得了回报。
“我正在使用它作为我自己的向导前进,”她说。“例如,我已经使用了我们的假设表。当我考虑研究问题时,将这个指南放在我面前是非常好的。这里不乏有趣或重要的问题,但这有助于我看到我可能有哪些问题。有机会回答。“
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