科学家们产生了高质量的小麦A基因组序列
面包小麦(Triticum aestivum L.)占人口的35%以上,提供人类消耗的卡路里和蛋白质的20%左右,是一种全球重要的作物,因为它对各种气候和改良谷物的适应性增强面包生产的质量。由于其复杂的多倍性(六倍体,含有A,B和D三个亚基因组)和大基因组大小(17 Gb),面包小麦的遗传和功能分析极具挑战性。
A基因组源自二倍体野生einkorn小麦Triticum urartu,基因组大小约为5 Gb,是面包小麦和其他多倍体小麦的基本基因组。它在小麦进化,驯化和遗传改良中发挥着核心作用。为了说明小麦的基因组结构,中国科学院的小麦基因组研究小组及其合作者通过结合BAC-by-BAC测序,单分子,真实,产生了高质量的T. urartu基因组序列。 - 时间,全基因组鸟枪测序和下一代绘图技术。
科学家们制作了7个染色体尺度的假分子,预测了41,507个蛋白质编码基因,并提出了T. urartu染色体的进化模型。然后他们发现,与水稻,高粱和短柄草相比,由于转座因子的广泛扩增和广泛的基因丢失,起源于T. urartu的古代基因组重复的共线性被强烈破坏。
与面包小麦的A,B和D亚基因组的比较分析也表明,在小麦进化过程中发生了四种大的染色体结构变异。人口基因组学分析显示,来自肥沃新月的T. urartu种质形成了三个不同的群体,对高海拔和生物应力具有不同的适应性,例如白粉病。
T. urartu的基因组序列为多倍体小麦基因组的分析提供了二倍体参考,是系统研究小麦和相关草的基因组进化和遗传变异的宝贵资源。它有望促进发现赋予小麦遗传改良重要特征的基因,以应对全球粮食安全和可持续农业的未来挑战。
研究结果在Nature的一篇论文中在线发表,标题为“小麦A亚基因组Triticum urartu祖先的基因组序列”。
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