研究人员对农场进行基因组测序以帮助改变生活
在世界范围内,包括奥塔哥大学研究员在内的国际科学家利用全基因组测序技术帮助诊断破坏非洲农场作物的植物病原体,为预防非洲经济至关重要的作物失败铺平了道路。奥塔哥大学解剖学系高级研究员Jo-Ann Stanton博士帮助开发了PDQeX,这是两种原型技术之一,可以在偏远的非洲农场进行全基因组测序。
“这项成就为快速准确的病原体鉴定开辟了道路,允许立即采取纠正措施以防止作物失败,”Stanton博士解释说。她说:“对于东非自给自足的农民来说,这是食物与收入或饥饿之间的区别。”“作物歉收意味着粮食安全的丧失,学费,供应,农场改良或维护无收入。”
该团队包括来自坦桑尼亚Mikocheni农业研究所,乌干达国家作物资源研究所,肯尼亚Jomo Kenyatta农业技术大学和西澳大利亚大学的科学家,在“木薯病毒行动项目”下与木薯种植者合作三个国家:坦桑尼亚,乌干达和肯尼亚。
木薯是一种生长面粉和类似于马铃薯的淀粉类蔬菜的热带树木的块根,受到病毒病原体的攻击,这些病原体会减少或破坏作物。受病毒威胁不断增长影响的农民依靠木薯作为主要食物来源和年收入。
斯坦顿博士说:“全球有8亿人依靠木薯作为其主要的卡路里来源,病毒传播是一个重大的全球威胁。”
作为一名研究人员,她的愿景是将复杂的分子诊断从实验室带到非专家手中,以便对现实生活中的情况做出快速,准确和具有成本效益的反应。这个项目正是如此。
使用手持式分子诊断设备,Stanton博士和该团队已经能够在农场进行全基因组测序。来自新西兰公司ZyGEM的允许现场DNA提取的装置(PDQeX)与英国公司Oxford Nanopore制造的MinIT碱基调用小型超级计算机一起使用。
将这些技术与便携式DNA测序仪MinION结合使用,可以在农场中选择叶,茎或昆虫样品,准备DNA进行测序,然后将原始数据转换为DNA序列读数以进行数据解释,所有这些都是真实的时间。
Stanton博士表示,从采样到诊断结果,整个过程不到四个小时,所有设备都是在农场户外工作的电池上运行。
她说,该项目不仅对非洲农民有重大影响。
“在更广泛的层面上,这一突破在人类和动物健康,环境管理和保护领域都有应用。
“随着人类活动的全球化加速,对准确,快速和现场诊断的需求也在增长。”
推荐内容
-
上海新增5例境外输入 重症病例无变化
【导读】近来国内疫情已经控制好了甚至是结束了,但是对于境外输入病例我们还是要第一时间警惕,今日有消息表示上海新增5例境外输入跟着小
-
香港疫情9月22日最新消息 新增8宗确诊 专家吁市民继续保持防疫意识
今天是9月22日,根据香港特区政府卫生署卫生防护中心22日公布的最新消息获悉,昨日香港新增8宗确诊病例,专家吁市民继续保持防疫意识,下面
-
本周柯南动画怎么了?本周柯南动画吐槽事件始末
本周柯南动画剧集,本周柯南动画怎么了?而对于本周柯南动画的这个话题,今天的你是否也在关注着?具体什么情况?下面跟小编一起来了解下。本
-
广州一小区住户爬钢筋上下楼 具体是怎么回事?
最近在广州一小区住户爬钢筋上下楼,这是怎么回事呢?满楼都说钢筋看起来可以说是十分危险,下面我们一起来看看具体详情。近日,在广州番禺
-
有针对性的治疗显示自身免疫性疾病的小鼠模型的承诺
目前对自身免疫疾病的治疗无差别地靶向功能失调和正常免疫细胞,使患者易患免疫缺陷。认识到这个问题,犹他大学健康大学的研究人员正致...
-
8月27日北京大屯路中科院疫情最新消息公布 日前,北京一高校环
众所周知,北京(Beijing),简称京,古称燕京、北平,是中华人民共和国的首都、直辖市、国家中心城市、超大城市。那么,你知道北京目前疫情
-
11月22日安徽疫情最新实时数据公布 安徽昨日无新增确诊病例
安徽无新增 尚在医学观察的密切接触者85人。据消息显示,2021年11月21日0-24时,安徽省报告无新增确诊病例,无新增疑似病例,无新增无症状
-
10月23日上海疫情最新实时数据公布 上海昨日无新增本土新冠
小编在这里提醒大家,疫情期间,尽量做到非必要不出行,如果一定要出行,要关注交通旅游信息,同时还要注意错峰出行,全程做好防护,尽...
-
11月16日大连疫情最新数据公布 昨日,大连新增7例本土确诊
提醒:疫情期间,请牢记新冠肺炎十大症状:发热(体温≥37 3℃)、干咳、乏力、嗅觉和味觉减退、鼻塞、流涕、咽痛、结膜炎、肌痛、腹泻...
-
广州这面旗帜全网刷屏怎么回事长什么样?2021向最美逆行者致敬
【导读】疫情蔓延,抗疫一线的他们很多已经超负荷运转,转发,致敬,请千万保重!据广州市疫情防控发布会通报,自5月26日启动重点区域全员核酸排