延时显微镜有助于揭示链霉菌生命周期中的制动机制
细菌用来抵御竞争对手的这些抗生素的生产 - 作为复杂生命周期的一部分进行协调,这种生命周期以孢子的形成结束。在孢子形成的繁殖过程中,细菌进入休眠状态,提高它们在不利条件下的存活率。如果研究人员能够理解如何控制这种生殖生命周期,他们可能能够利用临床上有用的抗生素的生产。
在今天发表在美国微生物学会期刊mBio上的一项研究中,John Innes中心的研究人员发现,一种关键蛋白质可以起到“制动”的作用,以确保链霉菌孢子形成的正确时间。这种蛋白质是一种叫做BldC的DNA结合蛋白。
研究小组表示,当他们通过去除编码蛋白质的基因来移除制动器时,孢子形成发生得太早。为了解这种BldC制动器是如何工作的,该团队使用了一种称为染色质 - 免疫沉淀 - 测序(ChIP-seq)的方法。该技术允许研究人员使用特异性抗体来鉴定BldC蛋白在链霉菌染色体上的结合位置。另一项称为RNA测序(RNA-seq)的技术使他们能够看到BldC蛋白打开或关闭哪些基因。
“这种方法表明BldC制动器的作用是通过在链霉菌非生殖性生长的时候保持孢子形成所需的重要基因,”第一作者Matt Bush博士解释说。“令我们惊讶的是,这些研究表明,除了切换一些基因外,BldC还可以切换其他基因。因为BldC在染色体上的许多位置结合,一种可能性是它也用于组织染色体的结构 - 它是一种类核相关蛋白。)“
在未来的研究中还有待回答的一个问题是:如何去除BldC-“制动器”?
该研究使用了模式生物,委内瑞拉链霉菌(Streptomyces venezuelae)(“Sven”)。S.委内瑞拉的主要优点是,与其他模式物种不同,它在液体和固体琼脂平板上形成孢子。“这意味着我们可以使用延时荧光显微镜来实现链霉菌的电影实时进行孢子到孢子的整个生命周期。我们可以在细胞中的蛋白质上放一个荧光”标签“,看看它在哪里在这里,我们在产生孢子的细胞分裂事件所需的“FtsZ”蛋白上加上一个标签。布什博士说。
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