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提出了蛋白质复合物的周期表

今天发表在“ 科学”杂志上的蛋白质复合物周期表提供了一种新的方式来观察蛋白质在自然界中可以构建的各种结构,接下来可能会发现这些结构,并预测如何设计出完全新颖的结构。该表由Wellcome Genome Campus和剑桥大学的研究人员领导的跨学科团队创建,为进化和蛋白质工程研究提供了宝贵的工具。

提出了蛋白质复合物的周期表

几乎每个生物过程都依赖于蛋白质以特定方式相互作用和组装成复合物,并且许多疾病与复杂组装中的问题相关。支持该组织的原则尚未完全了解,但通过定义蛋白质复合物进化的基本步骤,新的“周期表”提供了蛋白质组装的系统,有序观点,为理解生物功能提供了可视化工具。

“进化已经产生了各种各样的蛋白质复合物,它看起来有点混乱,”以前来自惠康基因组校园和现在爱丁堡大学MRC人类遗传学部门的Joe Marsh解释道。“但如果你打破了蛋白质成为复合物的步骤,那么有一些基本规则可以解释人们迄今为止观察到的几乎所有组件。”

不同的舞厅舞蹈可以看作是少数基本步骤的无穷无尽的组合。类似地,蛋白质复合物组装的“舞蹈” 可被视为二聚化的无限变异(一个双倍,变成两个),环化(一个形成三个或更多的环)和亚基添加(两个不同的蛋白质相互结合) 。因为这些是以一种相当可预测的方式发生的,所以它并不像你想象的那样难以预测新蛋白质是如何形成的。

“我们正在为混乱的蛋白质复合物世界带来大量的秩序,”剑桥大学卡文迪什实验室的Sebastian Ahnert解释说,他是一位经常纠缠生物问题的物理学家。“蛋白质可以继续经历这些简单步骤的多次迭代,增加越来越多的复杂程度并产生各种各样的结构。我们所做的是基于这些基本原则的分类,帮助人们处理复杂性。“

塞巴斯蒂安补充说,规则的例外情况本身就很有趣,正如正在进行的研究一样。“通过分析已经通过实验确定三维结构的成千上万种蛋白质复合物,我们可以看到发生的装配过渡中的重复模式 - 并且通过质谱的新数据,我们可以开始看到更大的图像, “乔说。

“这项研究的核心工作是在理论物理和计算生物学方面,但如果没有牛津大学同事的质谱工作,就不可能做到这一点,”欧洲生物信息学研究所研究组组长Sarah Teichmann补充道。 -EBI)和Wellcome Trust Sanger Institute。“这是跨学科研究极为有价值的另一个很好的例子。”

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