斑马鱼基因组发现与人类惊人相似
根据发表在“自然”杂志上的一篇论文,70%的蛋白质编码人类基因与斑马鱼(Danio rerio)中发现的基因有关,84%的已知与人类疾病有关的基因与斑马鱼相对应。
该团队开发了一个高质量的注释斑马鱼基因组序列,以与人类参考基因组进行比较。只有两个其他大型基因组已被测序为这一高标准:人类基因组和小鼠基因组。完成的斑马鱼基因组将成为推动人类基因功能和疾病研究的重要资源。
斑马鱼在生物学上与人类非常相似,与人类共享大部分相同的基因,使其成为理解基因如何在健康和疾病中发挥作用的重要模型。
“与所有生物医学研究一样,我们与这个项目的目标是改善人类健康。该基因组将使研究人员了解我们的基因如何发挥作用以及遗传变异如何以人类或其他生物体无法轻易研究的方式引起疾病,“研究高级作者Wellcome Trust Sanger Institute的Derek Stemple博士说。
斑马鱼的研究已经导致了癌症和心脏病研究的生物学进展,并且正在推动我们对肌肉和器官发育的理解。斑马鱼已被用于验证肌营养不良症的因果基因,也用于了解黑色素瘤或皮肤癌的演变和形成。
“绝大多数人类基因在斑马鱼中都有对应物,特别是与人类疾病相关的基因。这种高质量的基因组证明了许多从事该项目的科学家,并将在未来几年内推动生物学研究。通过对斑马鱼中的这些人类疾病基因进行建模,我们希望世界各地的资源能够产生关于这些基因功能的重要生物信息,并可能找到药物开发的新目标,“Wellcome Trust Sanger Institute的资深作者Jane Rogers教授解释道。
斑马鱼基因组具有一些独特的特征,在其他脊椎动物中没有。它们在基因组序列中具有最高的重复含量,迄今为止在任何脊椎动物物种中都有报道:几乎是它们最近的亲戚鲤鱼的两倍。该团队也是斑马鱼独有的,它确定了影响性别决定的染色体区域。
与人类基因组相比,斑马鱼基因组包含很少的假基因 - 被认为通过进化失去其功能的基因。
该团队在斑马鱼基因组中鉴定了154个假基因,这是人类基因组中发现的13,000个左右假基因的一小部分。
“为了实现斑马鱼对人类健康的益处,我们需要全面了解基因组 - 包括与人类基因组的相似性和差异。有了斑马鱼基因组,我们现在可以更好地了解基因组的变化如何导致疾病,“马克斯普朗克发育生物学研究所的共同作者和诺贝尔奖获得者ChristianeNüsslein-Volhard教授说。
“这个基因组将有助于揭示导致常见和罕见疾病的生物过程,并为疾病筛查和药物开发开辟了令人兴奋的新途径,”Stemple博士说。
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