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苏门答腊犀牛基因组测序

一个国际科学家小组为濒临灭绝的苏门答腊犀牛(Dicerorhinus sumatrensis)制作了第一个全基因组序列,这是五种活犀牛中最小的一种,也是亚洲本土的三种犀牛之一。

这是辛辛那提动物园的苏门答腊犀牛(Dicerorhinus sumatrensis)Ipuh的照片。 图片来源:Tom Uhlman。

动物的肩高可达3.67 - 4.76英尺(1.12 - 1.45米)。它的体长为7.7 - 10.4英尺(2.36 - 3.18米),尾长为14 - 28英寸(35-70厘米)。据报道,重量范围为500至1,000千克。

这两种深层皮肤褶皱可以很容易地识别出腿部和躯干之间的身体,以及它的厚实的短硬毛。两个角装饰着鼻子,虽然额角比鼻角更明显。

苏门答腊犀牛的视力相对较差,更多地依靠听觉和嗅觉来检测周围发生的事情。动物的耳朵具有相对宽的旋转范围以检测声音和极好的嗅觉,以便容易地警告它们存在捕食者。

这种动物曾经发生在不丹喜马拉雅山脉和印度东北部的山脚下,穿过中国南部,缅甸,泰国,柬埔寨,老挝人民民主共和国,越南和马来半岛,并进入印度尼西亚的苏门答腊岛和婆罗洲岛。

狩猎和栖息地的丧失使它成为最稀有的大型哺乳动物之一,尽管经过数十年的保护努力,该物种面临灭绝。到2011年,只有大约200只苏门答腊犀牛被认为仍然生活在野外。

“该物种在很长一段时间内已经濒临灭绝,”共同作者特里·罗斯说,他来自辛辛那提动植物和植物园濒危野生动物保护和研究中心。

据该团队称,苏门答腊犀牛种群达到顶峰,此时化石证据显示大约90万年前大陆哺乳动物入侵Sundaland。

研究人员说:“大约12000年前 - 更新世末期 - 许多大型哺乳动物遭受了损失,而苏门答腊犀牛也不例外。”

“海平面上升淹没了Sundaland走廊,连接婆罗洲,爪哇岛和苏门答腊岛与马来半岛和亚洲大陆的陆桥消失在海洋中。”

“最有可能的结果是,随着适宜的栖息地变得越来越分散,犀牛的数量减少了。从那时起,由于与栖息地丧失和狩猎有关的压力增加,苏门答腊犀牛种群数量进一步减少。“

马歇尔大学的主要作者赫尔曼梅斯博士说:“他们的人口已经触底,从未出现过复苏的迹象。”

科学家通过使用称为成对顺序马尔可夫聚结的方法得出了这些结论。

他们说:“我们估计苏门答腊犀牛种群在约95万年前估计有效种群数量达到约5700人,达到顶峰。”

“到9000年前,基因组证据显示,有效种群数量减少到只有约700只苏门答腊犀牛。”

研究结果表明,遥远过去的气候变化减少了苏门答腊犀牛的遗传多样性,使他们更容易受到人类活动后来的压力。

“我们测序的DNA样本属于一只名为Ipuh的犀牛,位于苏门答腊岛最初收集的地方之后,”作者说。

“Ipuh在辛辛那提动物园住了22年,直到2013年去世,他的遗体仍然在辛辛那提博物馆中心展出。Ipuh的两个儿子继续住在苏门答腊的苏门答腊犀牛保护区。其中一人已经生了两头牛犊。“

“苏门答腊犀牛种类被一条线挂在上面。我们需要做更多的事情来拯救它,“罗斯说。

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