22,000岁大熊猫的线粒体DNA揭示了长期失落的血统
一个研究小组在古脊椎动物与古人类研究所,中国院士,研究所的科学家领导分析了来自中国南方发现了一个22000岁的大熊猫标本中分离的线粒体DNA,发现古熊从现今的分离巨头大熊猫(Ailuropoda melanoleuca)大约在183,000年前,这表明它属于今天未发现的一个独特的群体。
在中国广西省乐业县的Cizhutuo洞穴中发现了一只古老的大熊猫(放射性碳的日期为21,910-21,495年)的头骨。
它的年龄和位置在广西省,今天没有野生大熊猫,以及在炎热潮湿地区保存DNA的难度,将其作为一个独特的标本来了解上一个冰河时代的古代大熊猫。
“使用单个完整的线粒体DNA(mtDNA)序列,我们发现了一个独特的线粒体谱系,这表明Cizhutuo panda虽然在遗传上与现在的大熊猫比其他熊更密切相关,但它与共同的祖先有着深刻的独立历史。现代大熊猫,“主要作者Qiaomei Fu博士解释说,他是脊椎动物古生物学和古人类学研究所脊椎动物进化和人类起源重点实验室的研究员。
“这真的突出了我们需要对来自古老大熊猫的更多DNA进行测序,以真正了解它们的遗传多样性随时间的变化以及它们与当前,更受限制和分散的栖息地的关系。”
在这项研究中,傅博士和合着者使用复杂的方法从古代洞穴标本中提取mtDNA。
这是一个特别的挑战,因为标本来自亚热带环境,这使得DNA的保存和回收变得困难。
为了恢复Cizhutuo panda的完整线粒体基因组,研究人员测序了148,326个DNA片段,并将它们与大熊猫线粒体基因组参考序列对齐。
然后他们使用新的基因组以及来自138只现今熊和32只古代熊的线粒体基因组构建了一个家谱。
他们的分析表明,Cizhutuo panda与现今大熊猫的祖先之间的分裂可以追溯到大约183,000年。
Cizhutuo panda还拥有18个突变,可以改变6个线粒体基因的蛋白质结构。
这些氨基酸的变化可能与古代大熊猫在广西省的独特栖息地有关,也可能与上一个冰河时期的气候差异有关。
“Cizhutuo个体在上一个冰河时期生活在亚热带环境中,而今天的大熊猫生活在温带环境中,”科学家说。
“这一点,以及20万年前大约20万年前人口可能分化的东亚地区气候较冷,可能在其mtDNA谱系观察到的不同历史中发挥了作用。”
“将Cizhutuo panda的核DNA与现今的全基因组数据进行比较,可以更全面地分析Cizhutuo标本的进化历史,以及它与现今大熊猫的共同历史,”Fu博士补充说。
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