研究人员序列大麦基因组
由德国莱布尼茨植物遗传与作物植物研究所的Nils Stein博士领导的国际大麦基因组测序联盟绘制了大麦(Hordeum vulgare)的全基因组图谱,这是世界上仅次于小麦的第四大谷类作物,大米和玉米。该研究发表在“自然”杂志上。
大麦是最早的驯化谷物之一,起源于1万多年前的肥沃新月。
它在从北极圈到热带的所有温带地区广泛种植。除了地理适应性之外,大麦还因其对寒冷,干旱,碱和盐度的耐受性而闻名。
大麦是早餐谷物和通用面粉,有助于面包上升。麦芽啤酒赋予啤酒颜色,身体,蛋白质以形成良好的头部,以及发酵所需的天然糖。
这项新研究提供了对麦芽制作过程至关重要的基因家族的见解。
在大麦基因组序列也使已驯化过程中受到遗传瓶颈的基因组中,知识,帮助指导育种者的作物改良努力优化遗传多样性的区域的识别。
“这使得研究大麦的研究人员更容易专注于可实现的目标,从新的品种开发到育种再到基因的机械研究,”共同作者Timothy J. Close说,他是加利福尼亚大学遗传学教授。 ,里弗赛德。
“该研究还将帮助科学家与其他谷类作物合作。”
大约10年前,国际大麦基因组测序协会开始组装一个完整的大麦基因组参考序列。
这是一项艰巨的任务,因为大麦基因组的大小几乎是人类基因组的两倍,其中80%由高度重复的序列组成,如果没有相当大的额外努力,这些序列无法准确地分配到基因组中的特定位置。
本文使用多种新策略来规避这种基本限制。测序技术,算法设计和计算方面的重大进步使其成为可能。
研究人员解释说:“大麦基因组是谷类作物中最大的基因组之一,是人类基因组的两倍。”
“大麦是真正的二倍体,因此,它是小麦族的遗传学和基因组学的天然原型,包括多倍体小麦和黑麦。”
该研究提供了39,734个高可信度大麦基因的知识。
“自石器时代以来,酒精饮料一直是用麦芽制成的,有些人甚至认为这是人类采用植物栽培的一个主要原因,至少在肥沃的新月中,”Close教授和共同作者说。
在发芽期间,淀粉酶蛋白质由发芽的种子产生,以分解储存在干燥谷物中的富含能量的淀粉,产生简单的糖。这些糖可用于酵母发酵生产酒精,“他们解释说。
“基因组序列显示出比编码淀粉酶的基因所预期的更多变异性。”
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