科学家对海参基因组进行测序
来自加拿大和中国的一个国际研究小组对经济上重要的Apostichopus japonicus(俗称日本尖刺海参或日本海参)的基因组进行了测序
海参是Holothuroidea的成员,Holothuroidea是一种棘皮动物(一种也包括海胆和海星的门)。
它们在海鲜和制药行业中备受推崇,并且在没有硬化钙外骨骼的棘皮动物中具有独特性,并且具有显着的再生能力。
为了探索这些特征的遗传基础,中国研究员Jianhai Xiang博士及其合着者对日本刺参进行了高清基因组测序,覆盖了其估计的880兆碱基DNA的92%,其中包括30,350个蛋白质编码基因。
“通过比较日本刺参的基因组与其他生物的基因组,我们发现了大约5.33亿年前棘皮动物与半卵形动物分离的证据,海参与大约4.79亿年前的其他棘皮动物类分离,”作者说。
“我们发现虽然海胆基因组包含31个生物矿化基因,但对于形成钙化骨架至关重要,但海参只有7个这样的基因。”
“我们还发现,海参在整个发育过程中表达了这些生物矿化基因的水平要低得多,可能与海胆相比,它们的身体更柔软。”
作为一种吓跑捕食者的策略,海参可以驱逐他们的内脏,然后他们可以在几周内再生。
Xiang博士及其同事发现了一组重复的基因 - 称为PSP94样基因 - 在海参的再生肠中特异性表达,在其他棘皮动物中没有相应的基因,这表明这些基因可能对动物至关重要。 '能够迅速重新生长他们的内脏。
第二组称为纤维蛋白原相关蛋白的基因也被复制并在再生过程中高度表达,这表明它们也可能有助于这种能力。
“海参是一种特别有前途的再生医学模型动物,其基因组的可用性应有助于研究再生生物学,并确定棘皮动物再生能否提供可用于人类医学的见解,”湘博士说。 ,中国科学院海洋研究所研究员。
“我们的研究结果还应有助于了解棘皮动物的可持续利用和有效育种的要求,以支持高价值的海参产业,包括将其用作食品和中药的来源。”
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