科学家破解甘蔗蟾蜍的遗传密码

一组科学家从新南威尔士大学悉尼,悉尼大学,迪肯大学,葡萄牙和巴西的甘蔗蟾蜍的DNA得到缓解,一种有毒的两栖动物,这是一个对许多澳大利亚本土物种的威胁。研究结果发表在学术期刊GigaScience今天。

“尽管其标志性的地位,有很大的差距在我们对甘蔗蟾蜍遗传学的理解,直到现在,还没有人把基因组在一起,”彼得说白色,项目负责人和新南威尔士大学微生物学和分子生物学教授。

十年前,研究人员在佤邦已经试图甘蔗蟾蜍的基因组序列,但他们遇到障碍时组装,并没有完成这个项目。

对于这个项目,悉尼UNSW-University团队在Ramaciotti新南威尔士大学基因组学中心,发挥了作用在其他澳大利亚标志性物种的基因组解码,包括考拉。

“测序和组装基因组是一个复杂的过程。通过使用最先进的测序技术和专业知识在新南威尔士大学,我们360多亿碱基对测序和组装质量最好的两栖动物基因组到目前为止,“高级讲师丰富爱德华兹博士说,该研究的第一作者。

“我们设法破译超过90%的甘蔗蟾蜍基因序列使用技术,可以很长的DNA片段,使基因组拼图放在一起的任务变得更加容易。”

拥有一个草案甘蔗蟾蜍基因组将帮助关闭关键知识差距,加快甘蔗蟾蜍的研究。更多的蟾蜍现在可以测序的一小部分成本,自由和基因组available-anyone现在可以访问,开展进一步的研究。

“未来的基因组分析将提供洞察甘蔗蟾蜍进化和丰富我们对与在大型it生态系统的相互作用的理解将有助于我们理解利差的蟾蜍,它的毒素是如何工作的,并提供新的途径来控制人口,“甘蔗蟾蜍专家说,从悉尼大学名誉教授里克发光。

“很少有两栖动物的基因组已经测序迄今为止,所以这也是好消息两栖动物。有一个参考基因组可以提供宝贵的见解如何入侵物种进化以适应新环境。”

的基因组还将帮助研究人员找到新选项控制蟾蜍人口。

“当前措施物理删除没有成功,但新方法教本地物种不吃蛤蟆大叫味道aversion-give新的希望。但是,我们需要更多的方法来控制这种入侵物种,”怀特教授说。

对于这样的一个替代measure-biocontrol,即使用一种病毒来帮助控制蟾蜍蟾蜍的老百姓造成的遗传物质是至关重要的。

“找到一个病毒生物防除,我们需要访问蟾蜍的DNA和RNA,”爱丽丝Russo解释说,博士生在新南威尔士大学专门寻找潜在病毒控制蟾蜍。

“DNA包含古老的病毒DNA片段的动物有时目录过去感染。”

病毒曾被成功用于控制欧洲兔子人口。甘蔗蟾蜍病毒研究到目前为止的问题是,他们可能会感染原生amphibians-which为什么这项研究旨在找到一种甘蔗toad-specific病毒.

在本月发表的一篇论文病毒学杂志》上,研究人员描述他们如何取样甘蔗蟾蜍澳大利亚从不同的位置,使用结合DNA和RNA序列,发现了三种新的病毒。

“直到我们发表这篇文章,只有一个家庭的病毒会影响甘蔗蟾蜍。这是第一篇论文,发现不同的病毒,非常有前途的,”罗威说。

“这篇论文已经打开了门:我们发现一种逆转录病毒,小核糖核酸病毒和圆环病毒基因类似于病毒感染的青蛙,爬行动物和鱼类。对于他们两个,我们发现一个完整的genome-both可能被用作生物防治剂。”

了解这些新病毒序列将帮助未来的研究将调查其患病率和生物电控制的潜在代理。

“还有很多工作要做。然而,这两个文件是当然这不是最重要的步骤在找到一个有效的方法来控制甘蔗蟾蜍,”怀特教授总结道。

甘蔗蟾蜍的适应性很强,对入侵地区的原生动物造成破坏性的影响,其中有很多;他们目前在138个国家。介绍了自蟾蜍在昆士兰的控制甘蔗甲虫在1935年,它已经蔓延widely-millions蟾蜍占据120万多平方公里。它致命的毒药本地物种种,淡水鳄鱼,和一些种类的原生蜥蜴和蛇。

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