从细菌细胞中分离质粒DNA的自动化
从细菌中分离质粒DNA是一种重要的分子生物学方法,用于产生用于优选下游反应的模板DNA。质粒分离方法是基本的; 然而,高通量质粒DNA提取一直具有挑战性,存在诸如低产量和基因组DNA(gDNA)污染的问题。
一种自动化,高通量,基于多孔的质粒提取技术,其产量适合下游应用且不含gDNA,将大大有利于高通量实验室,其中质粒提取经常成为瓶颈。
96孔二氧化硅过滤板质粒提取试剂盒可在市场上买到。在这些方法中,收获细菌细胞并通过碱裂解裂解,消除细胞碎片,然后通过结合二氧化硅膜收集提取的DNA。随后在洗脱纯化的DNA之前洗涤膜。
在本文中,耶拿描述了在SynbiCITE伦敦DNA铸造开发出一种技术,它使用CyBio ® FELIX移液平台自动96孔,二氧化硅过滤板基于质粒DNA提取协议。
使用的CyBio ® FELIX移液平台(图1)使96个样品,以在同一时间进行处理,在约1.5小时,用通用性同时处理大量的板。紧凑的平台最大限度地减少了实验室中自动质粒分离系统所需的工作台空间,并且与台式离心机和机械臂一起,可以实现完全自动化的质粒提取系统。使用该技术,从细菌培养物中分离出平均产量为65ng /μL的质粒DNA,样品之间的变异性较低(±7.7ng /μLSD)和50μL的洗脱体积。质粒DNA样品也具有高质量,适用于下游应用,如转化或测序。
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