苹果基因组序列有助于育种新品种的发表

本周的自然遗传学由一个国际科学家团队发表了一个高质量的苹果基因组序列，其中包括荷兰瓦赫宁根大学和研究所的研究人员。该序列的出版有助于更快和更有针对性地培育具有增加的抗病性，改善的生产性状和更好的果实品质的新苹果品种。有了这个，结果支持从环境和财务角度更可持续地生产苹果果实。

基因组序列由来自法国，意大利，德国，荷兰和南非的国际研究机构联合组织。基因组数据的高质量，表明超过4.2万个推定的基因，是使用最新测序技术的结果，这些技术产生了长链DNA序列，非常特定的苹果品种，以及苹果开发的信息量最大的遗传连锁图谱在早期的研究中。

基因组序列为苹果基因组的组织提供了新的见解。已经通过RNA测序验证了42,000个推定基因中的93%。这些知识可用于鉴定控制目标性状的基因，以及用于加速新品种育种的基于DNA的诊断测试的开发。

使用所谓的二单倍体苹果品种对本研究的成功至关重要。苹果是一种异交物种，使其基因组杂合。此外，苹果起源于两个不同物种之间的杂交，其与全基因组复制相结合。因此，每种常规苹果品种的每个DNA序列最多有四种变体。本研究中使用的二单倍体变种是特殊的，因为它每个序列只有两个变体。这导致显着的复杂性降低，这使得可以产生非常高质量的基因组序列。

苹果基因组的新见解包括对苹果17条染色体中重复模式的清晰认识。这有助于鉴定具有类似功能的基因拷贝。接下来，组装了所谓的“重复区域”。迄今为止，这些尚未表征的苹果基因组区域可能参与调节基因表达。最后，发现了一种新的重复序列，可能对着丝粒特异，这可能会导致染色体分裂和复制的新见解。

该研究由INRA-Angers的Etienne Bucher协调。瓦赫宁根大学和研究所的研究人员为基因组测序，基因组图谱和装配做出了贡献，运用他们在生物信息学方面的经验和技能，并尽早获得了苹果中高质量的参考遗传连锁图谱。

瓦赫宁根大学和研究所开发了新的苹果品种，产生了顶级品种'Elstar'，'Santana'和最近发布的'Natyra'。后两者适用于生物生产，因为这些品种具有抗病性。此外，'Santana'适合大多数患有轻微苹果过敏的人食用。

Wageningen将利用苹果DNA中的新见解进行有针对性的新品种选育。

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