使用网络来了解组织特异性基因调控
布里格姆妇女医院的研究人员已经发现,不同的组织功能来自核心生物机制,这些机器主要由组织共享,而不是来自他们自己的个体监管机构。在Cell Reports上发表的一篇论文中,网络医学的Channing部门的Kimberly Glass博士和她的团队解释了他们如何使用PANDA(在网络之间传递数据同化的属性)来创建转录因子和基因之间相互作用的网络模型,发现存在不同的组织功能是监管网络中细微的,组织特异性变化的结果。对于这些组织特定功能中的每一个,网络具有相同的核心组件,但它们以不同的方式与增加的遗传和环境信息组合。该团队分析了来自基因型 - 组织表达(GTEx)联盟以及其他监管信息来源的数据,以重建和表征38种组织的调节网络。
PANDA是Glass和她的团队在2013年创建的模型,因此可以更准确地模拟转录因子之间的相互作用 - 这有助于控制基因被激活的位置,时间和程度- 以及它们的目标。总结转录因子和基因之间的复杂相互作用是理解网络模式的重要一步,它告知基因调控如何产生各种特定的组织功能。
作者还观察到特定组织功能的调节很大程度上与转录因子表达无关。他们指出,人类基因组中大约有30,000个基因,但其中只有不到2,000个编码转录因子。
“必须进行大量的过程才能使组织正常运作,”格拉斯说。“我们发现将这些调节因子连接到其靶基因的网络被重新配置以更有效地协调这些组织功能的激活,而不是激活特定的转录因子来实现这些不同的过程。”
该团队指出,他们的工作突出了在开发药物治疗时考虑特定组织背景的重要性。鉴于转移的监管网络管理不同的功能,这对于理解药物在靶组织外的潜在副作用将是重要的。
推荐内容
-
计算人类基因组计划的经济影响
科学研发的公共资金对更广泛的经济具有显着的积极影响,但量化研究的确切影响可能难以评估。研究公司Battelle Technology Partnership P
-
牦牛基因组测序
由中国兰州大学领导的国际研究团队完成了雌性家牦牛的基因组序列。作为西藏的标志性象征,牦牛,Bos gr,是中国青海省生活在高海拔地区的
-
2021年追回医保资金234亿元 查处定点医药机构41.1万家
近日,国家医保局、公安部、国家卫生健康委联合召开2022年全国打击欺诈骗保专项整治行动电视电话会议。会议指出,2021年共检查定点医药机
-
在基因方面地衣拥抱共享经济
科罗拉多大学博尔德分校的研究人员发现了地衣中专性共生的第一个已知分子证据,这是一种独特的共同进化关系,可以揭示出一些多细胞生物...
-
被催熟的西红柿使人老得快?真是如此?
当我们不知道一件事真假的时候,不防多等等官方的回应。因为信息碎片化,很多小伙伴现在上网很容易只看到事情的一面就下定论,其实很多...
-
研究人员的目标是对全球微生物组进行编目
在任何快速变化的环境中,都有赢家而且有输家。人类微生物群 - 生活在人体内和身体上的巨大微生物群 - 也不例外。随着科学家对微生物组
-
关于昆虫DNA分析和生物多样性估计的新讨论
面对全球昆虫数量不断减少,科学家们不断扩大我们对全球无脊椎动物及其生物多样性的认识。昆虫是地球上最丰富的动物 - 它们超过全人类17
-
天气阴暗就是雾霾惹的祸?需要好好科普
互联网时代,每个人都是信息传播者,但是我们必须清楚一点:在没有获得真正证实的消息之前,千万不能随意散播谣言,很容易造成以讹传讹...
-
两部委联合发布《关于国家组织高值医用耗材(人工关节)集中带量
为平稳实施国家组织人工关节集中带量采购(以下简称“人工关节集采”)中选结果,确保中选产品及时供应,促进医疗机构规范使用集采品种...
-
不断发展的基因调控因子解释了我们与其他灵长类动物的一些差异
今天,生物学家在越来越多的数据中添加了一个重要发现,解释了为什么我们与黑猩猩和其他灵长类动物的亲属不同,尽管我们的基因非常相似...