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多国研究小组提出的古代蛋白质研究新标准

来自古植物组学新领域前沿机构的一组研究人员发布了指南,为其提供了坚实的基础。古代蛋白质被用于研究从灭绝物种到古代人类饮食到疾病进化等各种事物。该指南发表在Nature Ecology&Evolution,旨在支持该领域的良好实践,并确保产生强大,可重复的结果。

多国研究小组提出的古代蛋白质研究新标准

古老的蛋白质分析领域近年来已成为人们关注的焦点。古老的蛋白质比DNA保存时间长十倍,为科学家提供了对遥远过去的独特见解。新技术使这项工作日益强大,其结果越来越详细。科学家现在可以使用痕量的考古蛋白来重建已灭绝的巨型动物的关系,追踪史前的乳业传播,并描述数千年前死亡的人的免疫反应。这使研究人员能够更好地回答一系列问题,从灭绝物种的进化到过去人类饮食的重建,再到对慢性病的更好理解。

一套为新领域提供一致性的指南

作为一个年轻的学科,古老的蛋白质组学面临许多曾经挑战古代DNA领域的障碍,即数据报告标准缺乏一致性,认证措施和避免污染的程序。如果没有严格的标准,实验室污染和数据伪像很容易被误解,从而导致错误的声明。在这份出版物中,作者提出了许多古代蛋白质的采样,生成,分析和报告的“最佳实践”科学文献中的序列数据,以支持研究人员,审稿人和编辑。该团队引人注目,因为它包括来自这一新领域的许多顶尖大学和研究所的国际研究人员,包括马克斯普朗克人类历史科学研究所,马克斯普朗克进化人类学研究所,哥本哈根大学,大学约克大学,都灵大学,俄克拉荷马大学和苏黎世大学/苏黎世联邦理工学院。

作者强调,他们不打算制定严格的,不可弯曲的规则,或推翻现有标准,而是巩固和加强该领域的最佳实践。“毫无疑问,随着用于表征蛋白质的新实验室和统计策略的出现,这些指南将需要在社区内进行辩论并进一步更新,”马克斯普朗克进化人类学研究所的联合主要作者Frido Welker表示。“但是,我们希望这里提出的实践标准将有助于为古植物组学作为一种在各种领域中使用的技术奠定坚实的基础。”

利用新方法的潜力

特别是,研究人员强调,出版物必须至少提供有关如何生成和验证数据的充分细节,以便其他人可以有效地评估结果。“Palaeoproteomics拥有巨大的潜力,可以大大扩展考古学,古生物学和进化研究,”马克斯普朗克人类历史科学研究所的联合主要作者Jessica Hendy解释说。“至关重要的是,该学科要坚持高标准,以确保它能够满足这一潜力。”

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