个体猪的蛋白质特征使生产者能够通过遗传学确定肉的切割
欧盟的研究调查了个体猪的蛋白质特征,因此生产者将能够确定猪的遗传性切割肉。通过基因组分析,在确定所有主要牲畜物种中基因组的可变性方面取得了相当大的进展。然而,将基因组与其表型在肉质和生产者类型方面联系起来仍然具有挑战性。
“组学”技术的进步为广泛表现越来越多的个体收集提供了必要的工具。欧盟MarieSkłodowska-Curie个人奖学金援助项目MARKTHEPIG已应用新兴的现象学领域来合并来自组学技术的大量数据。表型组学是一门新兴的跨学科,系统地研究细胞和生物体水平的全基因组表型表现。
MARKTHEPIG适用于高度表型的猪
正如MARKTHEPIG项目协调员Luca Fontanesi教授所解释的那样:“目前项目的目的是利用博洛尼亚大学在高度表型猪中获得的知识,以更好地了解遗传和非遗传因素,这有助于动物的生产变异。“ 这些因素对设计该物种的选择和育种策略具有重要影响。
MARKTHEPIG使用基于质谱的蛋白质组学来鉴定可能描述内部或分子表型的新生物标记物,以预测基因水平上动物的生产性能。此外,项目结果为使用表型组学开辟了新的可能性,以更好地将猪作为动物模型进行表征。
干腌火腿的分子基础
动物新陈代谢的核心是它的肝脏。MARKTHEPIG首次描述了两个重要猪品种在肝脏及其蛋白质谱方面的分子差异。“总共捕获并鉴定了大约500个蛋白质组学斑点。其中25个导致在用于制备干腌火腿的两个主要重型猪的猪的肝脏中表达差异,”Fontanesi教授概述道。
就火腿或培根的作用而言,研究小组发现了肝脏蛋白质组学特征的差异,这可能间接地解释了肌肉组织水平的差异。该项目的工作成果刚刚在同行评审期刊PLOS ONE上发表。
蛋白质组学进展的挑战和解决方案
为了实现该项目的目标,MARKTHEPIG进行了当地实验室无法支持的高级蛋白质组学分析。作为一种解决方案,博洛尼亚大学的替代实验室提供了蛋白质组学方面的必要专业知识。
项目结束后,主机实验室打算继续进一步开发猪的分子表型。目标是进一步描述品种内和品种之间的遗传变异。“这些年来我们收集的生物库将为未来基于高通量分子表型技术的研究提供重要资源,”Fontanesi教授指出。
Fontanesi教授承认,居里个人研究员已经通过添加其它分子表型的群体启用猪的较大参考群体的形成猪已基因分型,并与许多另外的生物标记表型。“该资源将成为许多其他研究的参考人群,这些研究对猪的育种和选择部门以及基础生物学具有潜在的高影响,”他总结道。
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