研究描述了器官和组织再生过程中染色质的动态变化
来自巴塞罗那大学遗传学,微生物学和统计学系以及生物医学研究所(UB)的研究人员与基因组调控中心(CRG)合作,描述了基因表达的基因和调控元素。组织和器官再生的过程。该研究发表在Genome Research,通过下一代测序将经典遗传分析与染色质的新研究技术相结合。
作者分析了不同再生时期黑腹果蝇翅膀中成像盘的转录组。通过对大规模RNA测序的分析,他们鉴定了在该过程中差异表达的那些基因。此外,他们发现超过30%的这些基因位于基因簇中。由于对其他物种(小鼠和斑马鱼)进行了比较分析,作者发现了一组参与再生的基因,这些基因在所有物种中都是保守的。“了解这些生物体共有哪些基因可以帮助我们了解在具有更多有限再生技能的生物体中激活这一过程所必需的东西,例如人类,”Elena Vizcaya-Molina指出。
“这项研究表明,组学和生物信息学越来越重要,以了解基本的生物过程,”博士后CRG研究员和UB讲师Cecilia Klein指出。新的测序技术和生物信息学分析与实验研究的结合使研究人员能够在基因调控的理解方面取得进展,在这种情况下,再生。
再生中的监管要素
在这项研究中,研究人员还发现了三种与再生相关的调节元素:那些在再生过程中增加活性的元素,从其他发育阶段或其他组织中重复使用的元素,以及一组独特的再生元素。“这些调控元件是能够引导和塑造基因表达的DNA序列,”Elena Vizcaya说。作者还发现,这些元素可能被物种中的一些保守基因(苍蝇,小鼠和斑马鱼)激活。“ 再生的特定调节元件的异位激活可能是提高器官不能再生的再生能力的关键工具,”Montserrat Corominas说。
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