寻找一个城市的DNA 试试它的ATM
根据本周发表于美国微生物学会开放获取期刊mSphere的一项研究,纽约市的自动取款机键盘有大量的微生物,但它们大部分来自正常的人类皮肤,家庭表面或食物痕迹。“我们的研究结果表明,ATM键盘可以整合来自不同来源的微生物,包括人类微生物组,食物以及适应空气或表面的潜在新环境生物,”高级研究作者,基因组学中心主任Jane M. Carlton博士说。系统生物学,纽约大学生物学教授。“从ATM键盘获得的DNA因此可以提供人类行为和微生物环境来源的记录。”
在研究过程中 - 2014年6月和7月研究人员在纽约市研究微生物的更大努力的一部分 - 调查人员在纽约三个纽约自治市:曼哈顿,皇后区和布鲁克林的八个街区的66台ATM机上擦了几个键盘。其中四台机器位于室外。然后,在实验室中,他们用16S扩增子测序研究样品,用于鉴定和比较细菌; 和18S扩增子测序,用于鉴定寄生虫,真菌和原生生物(其他微观生物)。大多数样本中发现的最丰富的细菌是来自Actinobacteria,Bacteroides,Firmicutes和Proteobacteria的正常人类皮肤微生物。家庭。总体而言,细菌样本的多样性较低,并且没有明显的地理聚类。在18S测序中,研究人员发现了一些真菌和低水平的原生生物。
键盘上最常见的微生物来源是家用表面,如电视,洗手间,厨房和枕头。研究人员发现了来自硬骨鱼和软体动物的微生物,以及一些邻近自动取款机上的鸡肉,这表明餐食残留的DNA可能会留在人的手中,并在使用时转移到ATM键盘上。
位于自助洗衣店和商店的ATM键盘具有最高数量的生物标记物,其中最突出的是乳酸杆菌(乳酸菌),其通常存在于分解植物或乳制品中。在曼哈顿的样本中,研究人员观察了生物标志物Xeromyces bisporus,一种与变质烘焙食品相关的食源性霉菌。“似乎有理由认为这种真菌可能是从最近处理烘焙食品的人那里转移出来的,特别是在曼哈顿中城等通勤密集的地区,附近有许多便利店和向商业工人出售这类食品的咖啡馆, “卡尔顿说。
研究人员发现,在户外与室内ATM之间的键盘没有显着差异。
由于纽约市每个ATM键盘最有可能每天被数百人使用(并且可能与来自不同城市表面的空气,水和微生物接触),因此本研究中获得的微生物群落可能代表“平均”该研究的共同作者,纽约大学医学院人类微生物组计划副教授Maria Gloria Dominguez-Bello博士说,这个社区实际上汇集了来自不同来源的社区。
研究人员表示,地点之间相对缺乏多样性可能是由于定期清理机器,这会消灭一些微生物,以及游客使用ATM,来自其他地方的通勤者等。接下来,他们将研究城市猫,狗,老鼠,鸽子和蟑螂中的微生物。
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