外显子组测序可识别疾病突变并帮助诊断
DNA测序技术的进步使得能够分析大量人群的整个基因组。这些方法鉴定了与疾病相关的遗传变异,但尚未成功翻译用于临床。
外显子组测序仅分析编码蛋白质的人类基因组的1%,因此比全基因组测序更快且更具成本效益。这一选择性测序的好处已经由加州大学圣地亚哥医学院的Joseph Gleeson领导的国际团队揭晓,其中包括来自埃及,摩洛哥和卡塔尔的研究人员。它可用于识别新的致病突变并改善诊断。
使用外显子组测序Gleeson和他的同事分析了来自中东和亚洲大型近交系家族的118个个体的DNA。参与者患有神经发育障碍,例如小脑畸形,其特征在于大脑发育不良,以及由小脑畸形引起的运动障碍。
在这些患者中的22位中,研究人员发现了先前未与疾病相关的基因突变。在具有小头畸形的家庭成员中发现的一个突变位于 GFM2基因中,该基因编码参与能量代谢的蛋白质。另一个发现于Joubert综合征家族,这是一种影响小脑发育的罕见疾病,位于 EXOC8基因中,该基因编码突触传递所必需的蛋白质。
在10名患者中,外显子组测序的结果与临床诊断不同。这表明,至少在某些情况下,该方法可用于校正或修改基于症状进行的初始诊断。
“我们已经与中东的许多合作者一起使用外显子组测序3到4年,”Gleeson说。“与传统疾病的单基因测序等替代方法相比,它更具成本效益和直接性。
“为患者生成外显子组数据很容易,但解释并不那么简单,”他补充道。“我们与我们的合作医生保持密切联系,因此我们可以回到患者身上来澄清他们的病史,并确定有几例基因检测可以纠正诊断。”
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