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人类微生物组会议突出了已经开始重要的领域的研究进展

近250名科学家 - 包括微生物学家,医生,生物学家,计算生物学家,流行病学家,生物伦理学家,生态学家甚至是精神科医生 - 最近聚集在马里兰州贝塞斯达,参与人类微生物组:未来愿景,这是一次评估人类现状的会议。微生物组研究并制定了未来计划。人类微生物组由几万亿微生物组成,几乎栖息在人体的每个角落。大多数这些微生物与人类宿主和谐共处,在免疫功能,消化,新陈代谢和其他重要功能中发挥着至关重要的作用。一些微生物引起疾病和疾病。

人类微生物组会议突出了已经开始重要的领域的研究进展

对于组织者 - 其中包括来自马里兰大学巴尔的摩医学院,国立卫生研究院(NIH)和其他地方的科学家 - 这次会议是评估这一新兴领域的科学现状并提供反馈的重要机会。在差距,需求和挑战方面。

与会者讨论了如何研究人类微生物组,需要更加统一的规则和标准来收集样本,以及如何最好地分析数据。演讲探讨了生活方式,年龄和药物如何影响微生物组,并为其在肥胖,癌症和行为中的潜在作用提供了证据。

会议还探讨了以人类微生物组计划(HMP)为基础的研究方案。这个为期五年的项目由美国国立卫生研究院共同基金组织,于2012年达到高潮,公布了人类正常微生物群落构成的第一张图 - 以及这些微生物群落的遗传潜力 - 并建立了有价值的参考数据库。

组织者召开会议的部分原因是,美国国立卫生研究院的27个研究所和中心中有很多都有微生物组研究项目,或者有兴趣探索以微生物为主题的研究,国家HMP协调员Lita Proctor博士说。人类基因组研究所(NHGRI)。“一些研究所刚刚开始尝试找出微生物组研究在哪些研究组合中的应用。本次会议旨在为这些研究所提供这一领域的概述,”她说。

发言者涉及广泛的微生物组相关科学,包括基础生物学和微生物组的多样性; 用于研究微生物组的工具和方法; 以及微生物组对人类健康的潜在直接应用,包括其在免疫,哮喘和心脏病中的作用。这种多样性反映在一些会谈的标题,如“湿疹,免疫和皮肤微生物组”,“肺微生物组:挑战关于微生物和宿主呼吸道的旧范例”和“饮食,儿童营养和微生物“。

在一次演讲中,纽约大学的Maria Dominguez-Bello博士讨论了“现代与祖先的微生物学”。科学家们已经提出人类微生物组可能会受到生活方式和环境的极大影响。大多数人类微生物组研究都集中在西方人群,这使得一些科学家怀疑这项研究是否代表了所谓的“天然”微生物组。为了找到答案,Dominguez-Bello博士和她的研究团队冒险到南美洲的偏远地区,包括亚马逊流域,研究土着人民的微生物群,如Yanomamo印第安人。在那里,他们发现了微生物多样性的惊人差异,现在正在评估这些差异在雅诺玛米和西化人群之间的微生物组中的潜在影响。

另一位主持人探讨了微生物在炎症中的作用,并将其作为癌症发展的一个因素。来自佛罗里达大学医学院的Christian Jobin博士描述了证据表明某些微生物细胞不仅在宿主细胞中引起炎症,而且可以对宿主基因造成直接的DNA损伤,证明了微生物作用的两种机制。在癌症的进展。

来自纽约伊萨卡康奈尔大学的Ruth Ley博士正在研究肠道微生物组对宿主的影响。微生物组在一生中发生变化,并且随着饮食,疾病,医学治疗 - 特别是抗生素等 - 在儿童时期及以后迅速发生变化。她呼吁进行更多研究,以揭示哪些人类基因与微生物群相互作用以及这种相互作用是如何发生的。她正在研究双胞胎,以了解微生物组如何影响新陈代谢的遗传基础。Ley博士还希望更好地了解微生物组在影响行为以及生育和长寿方面的作用。

几位发言者介绍了将人类微生物组研究转化为临床治疗方法。加拿大安大略省金斯顿女王大学的Elaine Petrof博士讨论了微生物生态系统如何用于治疗耐药性艰难梭菌感染。来自明尼阿波利斯明尼苏达大学的医学博士Alexander Khoruts描述了粪便微生物移植有助于患有可能威胁生命的肠道疾病的人们的巨大希望。美国食品和药物管理局首席科学家Jesse Goodman,MD,MPH,提供了FDA对微生物组潜在应用的看法。

仍存在许多挑战

演讲者发言后强调需要进行更多研究。作为基础研究需求的一个例子,HMP的第二阶段将从2013财年至2015财年NIH共同基金的新资金(两到三个研究团队三年1500万美元)开始,以及其他方面的支持NIH研究所和中心。这一新阶段将探讨微生物组在健康和疾病中的作用。

“在第一个HMP阶段之后,我们面临的问题是,我们需要测量微生物组的哪些生物学特性才能理解它与人类健康的关系?” 普罗克特博士说。“这是一项艰巨的任务,所以我们以更有限的方式处理这个问题。我们希望这些新的资助将有助于建立新的微生物组研究模型,并创建一个社区资源,用于评估哪些生物特性在研究角色时最具信息性。微生物组对健康和疾病的影响。“

展望未来,科罗拉多大学博尔德分校的Rob Knight博士列出了微生物组研究领域的许多问题和挑战,包括降低临床使用微生物组测序的成本,从相关性研究转向研究中的因果关系研究,将动物模型中的发现转化为人类以及基于微生物组的疗法的调节。

“微生物组与多种NIH研究所和中心的利益相关的不同健康状况有很多种方式,”Knight博士说。“我们在知识和技术方面取得了令人瞩目的进步,这使我们能够在比其他领域更短的时间内从基本的生物学知识转向潜在的临床相关性。”

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